Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPHP41219 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPHP41219 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPHP41219 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPHP41219 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPHP41219 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPHP41219 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPHP41219 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPHP41219 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPHP41219 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPHP41219 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPHP41219 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPHP41219 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPHP41219 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPHP41219 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPHP41219 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPHP41219 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPHP41219 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPHP41219 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPHP41219 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPHP41219 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPHP41219 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPHP41219 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPHP41219 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPHP41219 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPHP41219 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPHP41219 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPHP41219 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPHP41219 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPHP41219 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPHP41219 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPHP41219 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPHP41219 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPHP41219 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPHP41219 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPHP41219 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPHP41219 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPHP41219 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPHP41219 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPHP41219 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPHP41219 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPHP41219 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPHP41219 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPHP41219 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPHP41219 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPHP41219 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPHP41219 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPHP41219 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPHP41219 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPHP41219 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPHP41219 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPHP41219 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPHP41219 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPHP41219 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPHP41219 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPHP41219 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPHP41219 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPHP41219 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPHP41219 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPHP41219 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPHP41219 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPHP41219 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPHP41219 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPHP41219 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPHP41219 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPHP41219 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPHP41219 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPHP41219 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPHP41219 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPHP41219 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPHP41219 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPHP41219 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPHP41219 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPHP41219 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPHP41219 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPHP41219 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPHP41219 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPHP41219 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPHP41219 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPHP41219 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPHP41219 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRPHP41219 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRPHP41219 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRPHP41219 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRPHP41219 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPHP41219 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPHP41219 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPHP41219 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPHP41219 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPHP41219 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPHP41219 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPHP41219 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPHP41219 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPHP41219 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPHP41219 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPHP41219 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPHP41219 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPHP41219 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPHP41219 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPHP41219 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms