Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCK1P35558 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCK1P35558 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCK1P35558 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCK1P35558 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCK1P35558 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCK1P35558 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCK1P35558 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCK1P35558 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCK1P35558 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCK1P35558 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCK1P35558 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCK1P35558 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCK1P35558 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCK1P35558 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCK1P35558 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCK1P35558 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCK1P35558 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCK1P35558 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCK1P35558 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PCK1P35558 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCK1P35558 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCK1P35558 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCK1P35558 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCK1P35558 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCK1P35558 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCK1P35558 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCK1P35558 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCK1P35558 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCK1P35558 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCK1P35558 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCK1P35558 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCK1P35558 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCK1P35558 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCK1P35558 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCK1P35558 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCK1P35558 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCK1P35558 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCK1P35558 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCK1P35558 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCK1P35558 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCK1P35558 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCK1P35558 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCK1P35558 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCK1P35558 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCK1P35558 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCK1P35558 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCK1P35558 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCK1P35558 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCK1P35558 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCK1P35558 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCK1P35558 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCK1P35558 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCK1P35558 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCK1P35558 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCK1P35558 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCK1P35558 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCK1P35558 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCK1P35558 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCK1P35558 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCK1P35558 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCK1P35558 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCK1P35558 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCK1P35558 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCK1P35558 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCK1P35558 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCK1P35558 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCK1P35558 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCK1P35558 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCK1P35558 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCK1P35558 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCK1P35558 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCK1P35558 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCK1P35558 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCK1P35558 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCK1P35558 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCK1P35558 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCK1P35558 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCK1P35558 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCK1P35558 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCK1P35558 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCK1P35558 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCK1P35558 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCK1P35558 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCK1P35558 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCK1P35558 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCK1P35558 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCK1P35558 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCK1P35558 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCK1P35558 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCK1P35558 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCK1P35558 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCK1P35558 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCK1P35558 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCK1P35558 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCK1P35558 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PCK1P35558 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCK1P35558 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCK1P35558 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCK1P35558 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms