Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNB1P35222 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNB1P35222 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms