Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP1P29466 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP1P29466 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP1P29466 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP1P29466 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP1P29466 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP1P29466 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP1P29466 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP1P29466 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP1P29466 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP1P29466 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP1P29466 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASP1P29466 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP1P29466 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP1P29466 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASP1P29466 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP1P29466 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP1P29466 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP1P29466 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP1P29466 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP1P29466 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP1P29466 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP1P29466 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASP1P29466 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP1P29466 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP1P29466 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP1P29466 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP1P29466 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP1P29466 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASP1P29466 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP1P29466 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP1P29466 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP1P29466 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP1P29466 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASP1P29466 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP1P29466 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP1P29466 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP1P29466 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP1P29466 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP1P29466 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP1P29466 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP1P29466 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP1P29466 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP1P29466 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP1P29466 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP1P29466 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASP1P29466 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CASP1P29466 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CASP1P29466 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP1P29466 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP1P29466 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP1P29466 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP1P29466 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP1P29466 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP1P29466 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP1P29466 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASP1P29466 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP1P29466 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP1P29466 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP1P29466 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP1P29466 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASP1P29466 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP1P29466 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP1P29466 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP1P29466 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP1P29466 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP1P29466 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP1P29466 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP1P29466 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP1P29466 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP1P29466 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP1P29466 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP1P29466 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASP1P29466 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP1P29466 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP1P29466 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP1P29466 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP1P29466 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP1P29466 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP1P29466 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP1P29466 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP1P29466 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP1P29466 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASP1P29466 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP1P29466 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP1P29466 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP1P29466 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP1P29466 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP1P29466 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP1P29466 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP1P29466 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP1P29466 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP1P29466 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP1P29466 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP1P29466 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP1P29466 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP1P29466 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP1P29466 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP1P29466 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP1P29466 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms