Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRB3P28472 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRB3P28472 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRB3P28472 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms