Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMA3P25788 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMA3P25788 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.7 ms