Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
EPHA1P21709 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EPHA1P21709 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
EPHA1P21709 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EPHA1P21709 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms