Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP2A2P16615 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2A2P16615 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2A2P16615 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms