Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF4P15884 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF4P15884 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF4P15884 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF4P15884 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF4P15884 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF4P15884 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF4P15884 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF4P15884 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF4P15884 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF4P15884 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF4P15884 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF4P15884 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF4P15884 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF4P15884 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF4P15884 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF4P15884 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF4P15884 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF4P15884 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF4P15884 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF4P15884 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF4P15884 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF4P15884 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF4P15884 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF4P15884 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF4P15884 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF4P15884 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF4P15884 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF4P15884 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF4P15884 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF4P15884 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF4P15884 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF4P15884 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF4P15884 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF4P15884 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF4P15884 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF4P15884 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF4P15884 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF4P15884 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF4P15884 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF4P15884 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF4P15884 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF4P15884 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF4P15884 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF4P15884 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF4P15884 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF4P15884 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF4P15884 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF4P15884 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF4P15884 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF4P15884 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF4P15884 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF4P15884 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF4P15884 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF4P15884 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF4P15884 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF4P15884 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF4P15884 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF4P15884 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF4P15884 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF4P15884 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF4P15884 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF4P15884 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF4P15884 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF4P15884 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF4P15884 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF4P15884 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF4P15884 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF4P15884 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF4P15884 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF4P15884 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCF4P15884 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF4P15884 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF4P15884 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF4P15884 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF4P15884 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF4P15884 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF4P15884 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF4P15884 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF4P15884 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF4P15884 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF4P15884 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF4P15884 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF4P15884 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF4P15884 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF4P15884 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF4P15884 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF4P15884 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF4P15884 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF4P15884 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF4P15884 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF4P15884 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF4P15884 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF4P15884 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF4P15884 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF4P15884 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF4P15884 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF4P15884 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF4P15884 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF4P15884 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms