Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA1P14867 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GABRA1P14867 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA1P14867 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA1P14867 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA1P14867 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA1P14867 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA1P14867 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA1P14867 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GABRA1P14867 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA1P14867 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA1P14867 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA1P14867 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA1P14867 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA1P14867 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA1P14867 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA1P14867 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GABRA1P14867 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA1P14867 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA1P14867 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA1P14867 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA1P14867 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA1P14867 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GABRA1P14867 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GABRA1P14867 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA1P14867 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA1P14867 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRA1P14867 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA1P14867 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms