Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT7P08729 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT7P08729 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT7P08729 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT7P08729 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT7P08729 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT7P08729 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT7P08729 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT7P08729 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT7P08729 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT7P08729 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT7P08729 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT7P08729 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT7P08729 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT7P08729 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT7P08729 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT7P08729 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT7P08729 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT7P08729 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT7P08729 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT7P08729 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT7P08729 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT7P08729 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT7P08729 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT7P08729 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT7P08729 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT7P08729 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT7P08729 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT7P08729 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT7P08729 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT7P08729 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT7P08729 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT7P08729 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT7P08729 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT7P08729 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT7P08729 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT7P08729 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT7P08729 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT7P08729 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT7P08729 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT7P08729 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT7P08729 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT7P08729 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT7P08729 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT7P08729 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT7P08729 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT7P08729 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT7P08729 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT7P08729 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT7P08729 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT7P08729 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT7P08729 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT7P08729 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT7P08729 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT7P08729 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT7P08729 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT7P08729 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT7P08729 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT7P08729 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT7P08729 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT7P08729 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT7P08729 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT7P08729 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT7P08729 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT7P08729 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT7P08729 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT7P08729 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT7P08729 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT7P08729 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT7P08729 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT7P08729 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT7P08729 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT7P08729 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT7P08729 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT7P08729 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT7P08729 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT7P08729 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT7P08729 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT7P08729 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT7P08729 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT7P08729 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT7P08729 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT7P08729 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT7P08729 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT7P08729 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT7P08729 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT7P08729 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT7P08729 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT7P08729 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT7P08729 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT7P08729 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT7P08729 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT7P08729 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT7P08729 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT7P08729 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT7P08729 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT7P08729 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT7P08729 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT7P08729 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT7P08729 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms