Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTCP00480 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTCP00480 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTCP00480 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTCP00480 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTCP00480 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTCP00480 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTCP00480 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTCP00480 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTCP00480 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
OTCP00480 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTCP00480 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTCP00480 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTCP00480 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTCP00480 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTCP00480 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTCP00480 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTCP00480 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTCP00480 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTCP00480 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTCP00480 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTCP00480 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTCP00480 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTCP00480 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTCP00480 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTCP00480 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTCP00480 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTCP00480 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTCP00480 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTCP00480 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTCP00480 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTCP00480 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTCP00480 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTCP00480 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTCP00480 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTCP00480 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTCP00480 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTCP00480 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTCP00480 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTCP00480 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTCP00480 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTCP00480 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTCP00480 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OTCP00480 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTCP00480 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTCP00480 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTCP00480 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTCP00480 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTCP00480 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTCP00480 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTCP00480 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTCP00480 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTCP00480 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTCP00480 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTCP00480 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTCP00480 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTCP00480 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTCP00480 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTCP00480 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTCP00480 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTCP00480 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
OTCP00480 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
OTCP00480 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTCP00480 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTCP00480 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTCP00480 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTCP00480 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTCP00480 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTCP00480 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTCP00480 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTCP00480 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTCP00480 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTCP00480 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTCP00480 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTCP00480 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OTCP00480 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTCP00480 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTCP00480 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTCP00480 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTCP00480 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTCP00480 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
OTCP00480 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTCP00480 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTCP00480 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTCP00480 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTCP00480 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTCP00480 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTCP00480 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTCP00480 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTCP00480 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTCP00480 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTCP00480 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTCP00480 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTCP00480 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTCP00480 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTCP00480 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTCP00480 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTCP00480 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTCP00480 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTCP00480 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms