Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.323e-7■■■■■ 45.3
DKC1O60832 EIPR1-203ENST00000406835 738 ntTSL 521.31■■□□□ 13e-7■■■■■ 45.3
DKC1O60832 EIPR1-204ENST00000435721 672 ntTSL 321.31■■□□□ 13e-7■■■■■ 45.3
DKC1O60832 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.813e-7■■■■■ 45.3
DKC1O60832 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 519.36■□□□□ 0.693e-7■■■■■ 45.3
DKC1O60832 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 45.3
DKC1O60832 EIPR1-212ENST00000478754 2932 ntTSL 517.48■□□□□ 0.393e-7■■■■■ 45.3
DKC1O60832 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 511.74□□□□□ -0.533e-7■■■■■ 45.3
DKC1O60832 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 310.07□□□□□ -0.83e-7■■■■■ 45.3
DKC1O60832 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.971e-7■■■■■ 45.3
DKC1O60832 MCF2L-226ENST00000486210 548 ntTSL 319.52■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 45.3
DKC1O60832 MCF2L-215ENST00000433807 557 ntTSL 414.69□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 45.3
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DKC1O60832 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.174e-7■■■■■ 45.2
DKC1O60832 TRAPPC9-208ENST00000520857 3693 ntTSL 1 (best)13.31□□□□□ -0.284e-7■■■■■ 45.2
DKC1O60832 TRAPPC9-202ENST00000438773 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.364e-7■■■■■ 45.2
DKC1O60832 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.865e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 SYT7-205ENST00000539468 2186 ntTSL 524.66■■□□□ 1.545e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.415e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 SYT7-210ENST00000545053 578 ntTSL 223.42■■□□□ 1.345e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.325e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.275e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.225e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.145e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.135e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.135e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.915e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 FAM169A-206ENST00000514200 751 ntTSL 420.51■□□□□ 0.875e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 SYT7-204ENST00000539246 1961 ntTSL 519.79■□□□□ 0.765e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 SLC2A9-206ENST00000505104 1659 ntTSL 1 (best)19.11■□□□□ 0.655e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.635e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.65e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 FAM169A-205ENST00000513277 803 ntTSL 318.76■□□□□ 0.595e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 NFIX-206ENST00000586797 1615 ntTSL 518.73■□□□□ 0.595e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.555e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.545e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.525e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.55e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.375e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.375e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.335e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.255e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 TTC28-AS1-210ENST00000430525 524 ntTSL 416.12■□□□□ 0.175e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 TTC28-AS1-204ENST00000424161 556 ntTSL 415.08■□□□□ 05e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 FAM169A-204ENST00000510609 5908 ntTSL 1 (best)14.95□□□□□ -0.025e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 TTC28-AS1-202ENST00000417497 627 ntTSL 314.87□□□□□ -0.035e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 EHMT1-218ENST00000495657 649 ntTSL 514.82□□□□□ -0.045e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.045e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 TTC28-AS1-211ENST00000430853 564 ntTSL 414.79□□□□□ -0.045e-10■■■■■ 45.1
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DKC1O60832 TTC28-AS1-203ENST00000419253 846 ntTSL 1 (best)13.99□□□□□ -0.175e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 NFIX-204ENST00000585382 1083 ntTSL 513.59□□□□□ -0.235e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 TRAF3IP1-204ENST00000462122 922 ntTSL 313.11□□□□□ -0.315e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 TTC28-AS1-218ENST00000453632 562 ntTSL 413.06□□□□□ -0.325e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 TTC28-AS1-205ENST00000425112 807 ntTSL 311.52□□□□□ -0.575e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 TTC28-AS1-214ENST00000435348 578 ntTSL 410.96□□□□□ -0.655e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 TTC28-AS1-220ENST00000454996 837 ntTSL 28.5□□□□□ -1.055e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 FAM169A-207ENST00000514215 5954 ntTSL 1 (best)6.83□□□□□ -1.325e-10■■■■■ 45.1
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DKC1O60832 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.615e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.725e-10■■■■■ 45.1
DKC1O60832 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.44□□□□□ -2.021e-323■■■■■ 45.1
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DKC1O60832 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.586e-15■■■■■ 44.9
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DKC1O60832 PMF1-205ENST00000497069 837 ntTSL 317.8■□□□□ 0.446e-15■■■■■ 44.9
DKC1O60832 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.016e-15■■■■■ 44.9
DKC1O60832 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.076e-15■■■■■ 44.9
DKC1O60832 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.156e-15■■■■■ 44.9
DKC1O60832 PMF1-BGLAP-201ENST00000320139 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.26e-15■■■■■ 44.9
DKC1O60832 PMF1-204ENST00000466489 933 ntTSL 1 (best)11.14□□□□□ -0.636e-15■■■■■ 44.9
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DKC1O60832 DKC1-211ENST00000484317 671 ntTSL 210.81□□□□□ -0.681e-323■■■■■ 44.8
DKC1O60832 DKC1-203ENST00000413910 851 ntTSL 58.88□□□□□ -0.991e-323■■■■■ 44.8
DKC1O60832 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.071e-323■■■■■ 44.8
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DKC1O60832 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.848e-7■■■■■ 44.8
DKC1O60832 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.428e-7■■■■■ 44.8
DKC1O60832 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.572e-8■■■■■ 44.8
DKC1O60832 CTDSPL-204ENST00000435525 371 ntTSL 318.63■□□□□ 0.572e-8■■■■■ 44.8
DKC1O60832 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.892e-8■■■■■ 44.8
DKC1O60832 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.473e-11■■■■■ 44.7
DKC1O60832 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.193e-11■■■■■ 44.7
DKC1O60832 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.093e-11■■■■■ 44.7
DKC1O60832 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.983e-11■■■■■ 44.7
DKC1O60832 RHOC-210ENST00000425265 866 ntTSL 321.18■□□□□ 0.983e-11■■■■■ 44.7
DKC1O60832 RHOC-217ENST00000527563 579 ntTSL 319.17■□□□□ 0.663e-11■■■■■ 44.7
DKC1O60832 RHOC-218ENST00000528831 463 ntTSL 318.41■□□□□ 0.543e-11■■■■■ 44.7
DKC1O60832 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.433e-11■■■■■ 44.7
DKC1O60832 RHOC-212ENST00000468093 1042 ntTSL 317.12■□□□□ 0.333e-11■■■■■ 44.7
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DKC1O60832 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.183e-11■■■■■ 44.7
DKC1O60832 RHOC-215ENST00000484054 521 ntTSL 515.31■□□□□ 0.043e-11■■■■■ 44.7
DKC1O60832 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.023e-11■■■■■ 44.7
DKC1O60832 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.023e-11■■■■■ 44.7
DKC1O60832 RHOC-216ENST00000484280 891 ntTSL 514.48□□□□□ -0.093e-11■■■■■ 44.7
DKC1O60832 AL603832.3-202ENST00000607158 807 ntTSL 513.6□□□□□ -0.233e-11■■■■■ 44.7
DKC1O60832 RHOC-214ENST00000478447 420 ntTSL 212.81□□□□□ -0.363e-11■■■■■ 44.7
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