RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468093.5

RHOC-212, Transcript of ras homolog family member C, humanhuman

TSL 3

Gene RHOC, Length 1,042 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOC-212ENST00000468093 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.23■■■■□ 3.39
RHOC-212ENST00000468093 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.93■■■□□ 2.7
RHOC-212ENST00000468093 ABCC9O60706 1549 aa31.27■■■□□ 2.6
RHOC-212ENST00000468093 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.49■■■□□ 2.47
RHOC-212ENST00000468093 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
RHOC-212ENST00000468093 NACADO15069 1562 aa30.14■■■□□ 2.42
RHOC-212ENST00000468093 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.11■■■□□ 2.41
RHOC-212ENST00000468093 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.03■■■□□ 2.4
RHOC-212ENST00000468093 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.96■■■□□ 2.39
RHOC-212ENST00000468093 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.4■■■□□ 2.3
RHOC-212ENST00000468093 SCRIBQ14160 1630 aa29.23■■■□□ 2.27
RHOC-212ENST00000468093 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.17■■■□□ 2.26
RHOC-212ENST00000468093 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.12■■■□□ 2.25
RHOC-212ENST00000468093 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.9■■■□□ 2.22
RHOC-212ENST00000468093 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.65■■■□□ 2.18
RHOC-212ENST00000468093 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
RHOC-212ENST00000468093 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.21■■■□□ 2.11
RHOC-212ENST00000468093 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.2■■■□□ 2.1
RHOC-212ENST00000468093 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
RHOC-212ENST00000468093 SMARCA4P51532 1647 aa27.97■■■□□ 2.07
RHOC-212ENST00000468093 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.9■■■□□ 2.06
RHOC-212ENST00000468093 NCAPD3P42695 1498 aa27.89■■■□□ 2.06
RHOC-212ENST00000468093 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.89■■■□□ 2.06
RHOC-212ENST00000468093 SMARCA2P51531 1590 aa27.84■■■□□ 2.05
RHOC-212ENST00000468093 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
RHOC-212ENST00000468093 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.71■■■□□ 2.03
RHOC-212ENST00000468093 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
RHOC-212ENST00000468093 HMGXB3Q12766 1538 aa27.63■■■□□ 2.01
RHOC-212ENST00000468093 WIZO95785 1651 aa27.53■■■□□ 2
RHOC-212ENST00000468093 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
RHOC-212ENST00000468093 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
RHOC-212ENST00000468093 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.14■■□□□ 1.94
RHOC-212ENST00000468093 NESP48681 1621 aa27.08■■□□□ 1.93
RHOC-212ENST00000468093 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.07■■□□□ 1.92
RHOC-212ENST00000468093 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.01■■□□□ 1.92
RHOC-212ENST00000468093 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.99■■□□□ 1.91
RHOC-212ENST00000468093 ERCC6Q03468 1493 aa26.98■■□□□ 1.91
RHOC-212ENST00000468093 CFTRP13569 1480 aa26.94■■□□□ 1.9
RHOC-212ENST00000468093 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.74■■□□□ 1.87
RHOC-212ENST00000468093 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.67■■□□□ 1.86
RHOC-212ENST00000468093 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.6■■□□□ 1.85
RHOC-212ENST00000468093 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.59■■□□□ 1.85
RHOC-212ENST00000468093 CUX2O14529 1486 aa26.58■■□□□ 1.85
RHOC-212ENST00000468093 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
RHOC-212ENST00000468093 PRDM2Q13029 1718 aa26.43■■□□□ 1.82
RHOC-212ENST00000468093 WDR62O43379 1518 aa26.42■■□□□ 1.82
RHOC-212ENST00000468093 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
RHOC-212ENST00000468093 ABCC8Q09428 1581 aa26.4■■□□□ 1.82
RHOC-212ENST00000468093 TOPBP1Q92547 1522 aa26.3■■□□□ 1.8
RHOC-212ENST00000468093 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.24■■□□□ 1.79
RHOC-212ENST00000468093 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.14■■□□□ 1.786e-6■■■□□ 16.7
RHOC-212ENST00000468093 CUX1P39880 1505 aa26.14■■□□□ 1.78
RHOC-212ENST00000468093 IFT140Q96RY7 1462 aa26.14■■□□□ 1.78
RHOC-212ENST00000468093 SOGA1O94964 1423 aa26.12■■□□□ 1.77
RHOC-212ENST00000468093 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
RHOC-212ENST00000468093 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.05■■□□□ 1.76
RHOC-212ENST00000468093 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.02■■□□□ 1.76
RHOC-212ENST00000468093 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
RHOC-212ENST00000468093 TOP2BQ02880 1626 aa25.95■■□□□ 1.74
RHOC-212ENST00000468093 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
RHOC-212ENST00000468093 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
RHOC-212ENST00000468093 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.744e-7■■■■■ 38.2
RHOC-212ENST00000468093 SYNJ1O43426 1573 aa25.91■■□□□ 1.74
RHOC-212ENST00000468093 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.87■■□□□ 1.73
RHOC-212ENST00000468093 TRIM41Q8WV44 630 aa25.84■■□□□ 1.73
RHOC-212ENST00000468093 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.83■■□□□ 1.73
RHOC-212ENST00000468093 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.75■■□□□ 1.71
RHOC-212ENST00000468093 OSCARQ8IYS5 282 aa25.74■■□□□ 1.71
RHOC-212ENST00000468093 WDR97A6NE52 1622 aa25.74■■□□□ 1.71
RHOC-212ENST00000468093 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
RHOC-212ENST00000468093 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.73■■□□□ 1.71
RHOC-212ENST00000468093 GRIN2BQ13224 1484 aa25.72■■□□□ 1.71
RHOC-212ENST00000468093 FBLN2P98095 1184 aa25.72■■□□□ 1.71
RHOC-212ENST00000468093 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
RHOC-212ENST00000468093 KIF27Q86VH2 1401 aa25.63■■□□□ 1.69
RHOC-212ENST00000468093 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.61■■□□□ 1.69
RHOC-212ENST00000468093 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.6■■□□□ 1.69
RHOC-212ENST00000468093 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
RHOC-212ENST00000468093 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.57■■□□□ 1.68
RHOC-212ENST00000468093 IGF1RP08069 1367 aa25.55■■□□□ 1.68
RHOC-212ENST00000468093 SYNJ2O15056 1496 aa25.51■■□□□ 1.67
RHOC-212ENST00000468093 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.51■■□□□ 1.67
RHOC-212ENST00000468093 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.48■■□□□ 1.67
RHOC-212ENST00000468093 PBRM1Q86U86 1689 aa25.43■■□□□ 1.66
RHOC-212ENST00000468093 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.4■■□□□ 1.66
RHOC-212ENST00000468093 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.37■■□□□ 1.65
RHOC-212ENST00000468093 GRIN2AQ12879 1464 aa25.34■■□□□ 1.65
RHOC-212ENST00000468093 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.33■■□□□ 1.65
RHOC-212ENST00000468093 ADAMTS12P58397 1594 aa25.32■■□□□ 1.64
RHOC-212ENST00000468093 CHD1O14646 1710 aa25.32■■□□□ 1.64
RHOC-212ENST00000468093 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
RHOC-212ENST00000468093 EEA1Q15075 1411 aa25.26■■□□□ 1.63
RHOC-212ENST00000468093 NUP160Q12769 1436 aa25.23■■□□□ 1.63
RHOC-212ENST00000468093 CUL7Q14999 1698 aa25.22■■□□□ 1.63
RHOC-212ENST00000468093 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.19■■□□□ 1.62
RHOC-212ENST00000468093 JPH4Q96JJ6 628 aa25.18■■□□□ 1.62
RHOC-212ENST00000468093 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.15■■□□□ 1.62
RHOC-212ENST00000468093 CEP170Q5SW79 1584 aa25.13■■□□□ 1.61
RHOC-212ENST00000468093 PRXQ9BXM0 1461 aa25.12■■□□□ 1.61
RHOC-212ENST00000468093 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.1■■□□□ 1.61
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