Protein–RNA interactions for Protein: O43639

NCK2, Cytoplasmic protein NCK2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK2O43639 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NCK2O43639 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCK2O43639 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCK2O43639 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NCK2O43639 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCK2O43639 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCK2O43639 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCK2O43639 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCK2O43639 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCK2O43639 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCK2O43639 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCK2O43639 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCK2O43639 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCK2O43639 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCK2O43639 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NCK2O43639 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCK2O43639 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCK2O43639 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCK2O43639 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCK2O43639 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCK2O43639 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCK2O43639 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCK2O43639 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCK2O43639 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCK2O43639 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCK2O43639 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCK2O43639 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCK2O43639 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NCK2O43639 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCK2O43639 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NCK2O43639 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCK2O43639 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCK2O43639 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCK2O43639 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NCK2O43639 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCK2O43639 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCK2O43639 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCK2O43639 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCK2O43639 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NCK2O43639 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCK2O43639 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCK2O43639 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCK2O43639 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCK2O43639 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCK2O43639 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCK2O43639 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCK2O43639 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCK2O43639 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCK2O43639 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCK2O43639 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCK2O43639 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCK2O43639 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NCK2O43639 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCK2O43639 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCK2O43639 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCK2O43639 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCK2O43639 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCK2O43639 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCK2O43639 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCK2O43639 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCK2O43639 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCK2O43639 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCK2O43639 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCK2O43639 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCK2O43639 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCK2O43639 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCK2O43639 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCK2O43639 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCK2O43639 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCK2O43639 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCK2O43639 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCK2O43639 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCK2O43639 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCK2O43639 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCK2O43639 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCK2O43639 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NCK2O43639 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCK2O43639 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCK2O43639 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCK2O43639 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCK2O43639 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCK2O43639 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCK2O43639 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCK2O43639 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCK2O43639 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCK2O43639 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCK2O43639 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCK2O43639 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCK2O43639 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCK2O43639 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCK2O43639 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCK2O43639 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCK2O43639 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCK2O43639 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCK2O43639 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCK2O43639 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCK2O43639 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCK2O43639 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCK2O43639 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCK2O43639 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms