Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.665e-14■■■■■ 28.4
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PRPF4O43172 WDR1-216ENST00000514319 719 ntTSL 513.2□□□□□ -0.33e-11■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 WDR1-217ENST00000515018 274 ntTSL 37.55□□□□□ -1.23e-11■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 WDR1-201ENST00000264785 549 ntTSL 47.11□□□□□ -1.273e-11■■■■■ 28.4
PRPF4O43172 C16orf58-208ENST00000567673 766 ntTSL 211.21□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 28.3
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PRPF4O43172 IL17RE-204ENST00000434065 2541 ntTSL 223.21■■□□□ 1.312e-11■■■■■ 28.3
PRPF4O43172 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.922e-11■■■■■ 28.3
PRPF4O43172 IL17RE-202ENST00000383815 2808 ntTSL 219.92■□□□□ 0.782e-11■■■■■ 28.3
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PRPF4O43172 TBL1XR1-217ENST00000626672 568 ntTSL 416.04■□□□□ 0.163e-8■■■■■ 28.3
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PRPF4O43172 TBL1XR1-202ENST00000413084 592 ntTSL 415.79■□□□□ 0.123e-8■■■■■ 28.3
PRPF4O43172 TBL1XR1-214ENST00000457928 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.573e-8■■■■■ 28.3
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PRPF4O43172 TBL1XR1-221ENST00000630833 567 ntTSL 43.81□□□□□ -1.83e-8■■■■■ 28.3
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PRPF4O43172 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.26e-9■■■■■ 28
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PRPF4O43172 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -06e-9■■■■■ 28
PRPF4O43172 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.136e-9■■■■■ 28
PRPF4O43172 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.276e-9■■■■■ 28
PRPF4O43172 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.366e-9■■■■■ 28
PRPF4O43172 PBXIP1-205ENST00000493133 707 ntTSL 312.29□□□□□ -0.446e-9■■■■■ 28
PRPF4O43172 MIER3-201ENST00000336942 601 ntTSL 56.42□□□□□ -1.386e-9■■■■■ 28
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PRPF4O43172 MIER3-210ENST00000497185 108 ntTSL 54.48□□□□□ -1.696e-9■■■■■ 28
PRPF4O43172 MIER3-208ENST00000452157 5240 ntTSL 1 (best)3.75□□□□□ -1.816e-9■■■■■ 28
PRPF4O43172 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.926e-9■■■■■ 28
PRPF4O43172 MIER3-206ENST00000440000 219 ntTSL 52.39□□□□□ -2.036e-9■■■■■ 28
PRPF4O43172 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.066e-9■■■■■ 28
PRPF4O43172 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.066e-9■■■■■ 28
PRPF4O43172 ZNF664-208ENST00000540009 753 ntTSL 321.57■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 28
PRPF4O43172 ZNF664-212ENST00000542820 802 ntTSL 1 (best)20.86■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 28
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