RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484194.1

HLA-E-202, Transcript of major histocompatibility complex, class I, E, humanhuman

Gene HLA-E, Length 726 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-E-202ENST00000484194 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.98■■■■■ 7.67
HLA-E-202ENST00000484194 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.4■■■■■ 6.62
HLA-E-202ENST00000484194 ABCC9O60706 1549 aa55.87■■■■■ 6.53
HLA-E-202ENST00000484194 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.48■■■■■ 6.15
HLA-E-202ENST00000484194 NACADO15069 1562 aa53.22■■■■■ 6.11
HLA-E-202ENST00000484194 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.97■■■■■ 6.07
HLA-E-202ENST00000484194 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.66■■■■■ 6.02
HLA-E-202ENST00000484194 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.29■■■■■ 5.96
HLA-E-202ENST00000484194 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.15■■■■■ 5.94
HLA-E-202ENST00000484194 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.12■■■■■ 5.93
HLA-E-202ENST00000484194 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.04■■■■■ 5.92
HLA-E-202ENST00000484194 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.9■■■■■ 5.9
HLA-E-202ENST00000484194 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.77■■■■■ 5.88
HLA-E-202ENST00000484194 SCRIBQ14160 1630 aa51.32■■■■■ 5.81
HLA-E-202ENST00000484194 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.32■■■■■ 5.81
HLA-E-202ENST00000484194 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.52■■■■■ 5.68
HLA-E-202ENST00000484194 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.51■■■■■ 5.68
HLA-E-202ENST00000484194 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.33■■■■■ 5.65
HLA-E-202ENST00000484194 NCAPD3P42695 1498 aa49.08■■■■■ 5.45
HLA-E-202ENST00000484194 SMARCA4P51532 1647 aa49.04■■■■■ 5.44
HLA-E-202ENST00000484194 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.97■■■■■ 5.43
HLA-E-202ENST00000484194 SMARCA2P51531 1590 aa48.94■■■■■ 5.42
HLA-E-202ENST00000484194 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.92■■■■■ 5.42
HLA-E-202ENST00000484194 HMGXB3Q12766 1538 aa48.78■■■■■ 5.4
HLA-E-202ENST00000484194 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.59■■■■■ 5.37
HLA-E-202ENST00000484194 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.56■■■■■ 5.36
HLA-E-202ENST00000484194 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.47■■■■■ 5.35
HLA-E-202ENST00000484194 ERCC6Q03468 1493 aa48.29■■■■■ 5.32
HLA-E-202ENST00000484194 NESP48681 1621 aa48.07■■■■■ 5.29
HLA-E-202ENST00000484194 CUX2O14529 1486 aa48.07■■■■■ 5.29
HLA-E-202ENST00000484194 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.95■■■■■ 5.27
HLA-E-202ENST00000484194 WIZO95785 1651 aa47.92■■■■■ 5.26
HLA-E-202ENST00000484194 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.67■■■■■ 5.22
HLA-E-202ENST00000484194 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.66■■■■■ 5.22
HLA-E-202ENST00000484194 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.62■■■■■ 5.21
HLA-E-202ENST00000484194 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.55■■■■■ 5.2
HLA-E-202ENST00000484194 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.51■■■■■ 5.2
HLA-E-202ENST00000484194 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.48■■■■■ 5.19
HLA-E-202ENST00000484194 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.41■■■■■ 5.18
HLA-E-202ENST00000484194 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.19■■■■■ 5.14
HLA-E-202ENST00000484194 CFTRP13569 1480 aa47.15■■■■■ 5.14
HLA-E-202ENST00000484194 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.1■■■■■ 5.13
HLA-E-202ENST00000484194 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.07■■■■■ 5.13
HLA-E-202ENST00000484194 WDR62O43379 1518 aa47.04■■■■■ 5.12
HLA-E-202ENST00000484194 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.82■■■■■ 5.09
HLA-E-202ENST00000484194 PRDM2Q13029 1718 aa46.76■■■■■ 5.08
HLA-E-202ENST00000484194 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.6■■■■■ 5.05
HLA-E-202ENST00000484194 ABCC8Q09428 1581 aa46.26■■■■■ 5
HLA-E-202ENST00000484194 TOPBP1Q92547 1522 aa46.21■■■■■ 4.99
HLA-E-202ENST00000484194 IFT140Q96RY7 1462 aa46.16■■■■■ 4.98
HLA-E-202ENST00000484194 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.11■■■■■ 4.97
HLA-E-202ENST00000484194 OSCARQ8IYS5 282 aa45.95■■■■■ 4.95
HLA-E-202ENST00000484194 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.93■■■■■ 4.94
HLA-E-202ENST00000484194 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.87■■■■■ 4.93
HLA-E-202ENST00000484194 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.75■■■■■ 4.92
HLA-E-202ENST00000484194 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.75■■■■■ 4.91
HLA-E-202ENST00000484194 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.75■■■■■ 4.91
HLA-E-202ENST00000484194 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.59■■■■■ 4.89
HLA-E-202ENST00000484194 SOGA1O94964 1423 aa45.59■■■■■ 4.89
HLA-E-202ENST00000484194 TRIM41Q8WV44 630 aa45.56■■■■■ 4.88
HLA-E-202ENST00000484194 CUX1P39880 1505 aa45.54■■■■■ 4.88
HLA-E-202ENST00000484194 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.54■■■■■ 4.88
HLA-E-202ENST00000484194 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.54■■■■■ 4.88
HLA-E-202ENST00000484194 WDR97A6NE52 1622 aa45.44■■■■■ 4.87
HLA-E-202ENST00000484194 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.39■■■■■ 4.86
HLA-E-202ENST00000484194 CHD1O14646 1710 aa45.32■■■■■ 4.85
HLA-E-202ENST00000484194 FBLN2P98095 1184 aa45.26■■■■■ 4.84
HLA-E-202ENST00000484194 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.23■■■■■ 4.83
HLA-E-202ENST00000484194 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.23■■■■■ 4.83
HLA-E-202ENST00000484194 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.23■■■■■ 4.83
HLA-E-202ENST00000484194 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.17■■■■■ 4.82
HLA-E-202ENST00000484194 GRIN2BQ13224 1484 aa45.17■■■■■ 4.82
HLA-E-202ENST00000484194 ARHGEF11O15085 1522 aa45.15■■■■■ 4.82
HLA-E-202ENST00000484194 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.14■■■■■ 4.82
HLA-E-202ENST00000484194 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.08■■■■■ 4.81
HLA-E-202ENST00000484194 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.04■■■■■ 4.8
HLA-E-202ENST00000484194 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.04■■■■■ 4.8
HLA-E-202ENST00000484194 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.02■■■■■ 4.8
HLA-E-202ENST00000484194 PBRM1Q86U86 1689 aa44.99■■■■■ 4.79
HLA-E-202ENST00000484194 TOP2BQ02880 1626 aa44.98■■■■■ 4.79
HLA-E-202ENST00000484194 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.97■■■■■ 4.79
HLA-E-202ENST00000484194 SYNJ2O15056 1496 aa44.97■■■■■ 4.79
HLA-E-202ENST00000484194 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.94■■■■■ 4.79
HLA-E-202ENST00000484194 SYNJ1O43426 1573 aa44.91■■■■■ 4.78
HLA-E-202ENST00000484194 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.82■■■■■ 4.77
HLA-E-202ENST00000484194 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.78■■■■■ 4.76
HLA-E-202ENST00000484194 ARAP1Q96P48 1450 aa44.7■■■■■ 4.75
HLA-E-202ENST00000484194 ADAMTS12P58397 1594 aa44.58■■■■■ 4.73
HLA-E-202ENST00000484194 GRIN2AQ12879 1464 aa44.56■■■■■ 4.72
HLA-E-202ENST00000484194 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.55■■■■■ 4.72
HLA-E-202ENST00000484194 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.51■■■■■ 4.72
HLA-E-202ENST00000484194 NUP160Q12769 1436 aa44.39■■■■■ 4.7
HLA-E-202ENST00000484194 CEP170Q5SW79 1584 aa44.33■■■■■ 4.69
HLA-E-202ENST00000484194 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.18■■■■■ 4.66
HLA-E-202ENST00000484194 KIF27Q86VH2 1401 aa44.16■■■■■ 4.66
HLA-E-202ENST00000484194 SHROOM2Q13796 1616 aa44.13■■■■■ 4.66
HLA-E-202ENST00000484194 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.07■■■■■ 4.65
HLA-E-202ENST00000484194 IGF1RP08069 1367 aa44.02■■■■■ 4.64
HLA-E-202ENST00000484194 CUL7Q14999 1698 aa44■■■■■ 4.63
HLA-E-202ENST00000484194 JPH4Q96JJ6 628 aa43.94■■■■■ 4.62
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