Protein–RNA interactions for Protein: O15514

POLR2D, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2DO15514 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR2DO15514 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR2DO15514 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2DO15514 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms