Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IRF6O14896 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IRF6O14896 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IRF6O14896 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IRF6O14896 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IRF6O14896 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IRF6O14896 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IRF6O14896 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IRF6O14896 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IRF6O14896 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IRF6O14896 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IRF6O14896 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IRF6O14896 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRF6O14896 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRF6O14896 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IRF6O14896 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRF6O14896 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRF6O14896 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRF6O14896 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRF6O14896 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IRF6O14896 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRF6O14896 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRF6O14896 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRF6O14896 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRF6O14896 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRF6O14896 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRF6O14896 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IRF6O14896 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRF6O14896 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRF6O14896 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRF6O14896 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRF6O14896 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRF6O14896 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRF6O14896 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRF6O14896 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRF6O14896 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRF6O14896 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRF6O14896 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRF6O14896 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRF6O14896 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
IRF6O14896 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
IRF6O14896 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRF6O14896 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRF6O14896 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRF6O14896 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRF6O14896 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRF6O14896 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRF6O14896 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRF6O14896 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRF6O14896 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRF6O14896 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
IRF6O14896 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRF6O14896 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRF6O14896 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IRF6O14896 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IRF6O14896 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRF6O14896 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
IRF6O14896 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRF6O14896 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRF6O14896 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRF6O14896 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRF6O14896 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRF6O14896 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRF6O14896 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRF6O14896 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRF6O14896 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRF6O14896 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRF6O14896 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRF6O14896 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRF6O14896 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRF6O14896 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRF6O14896 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRF6O14896 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRF6O14896 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRF6O14896 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
IRF6O14896 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRF6O14896 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IRF6O14896 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRF6O14896 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRF6O14896 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRF6O14896 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRF6O14896 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IRF6O14896 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRF6O14896 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRF6O14896 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRF6O14896 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRF6O14896 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRF6O14896 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRF6O14896 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRF6O14896 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRF6O14896 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRF6O14896 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRF6O14896 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRF6O14896 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRF6O14896 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRF6O14896 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRF6O14896 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRF6O14896 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
IRF6O14896 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IRF6O14896 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.7 ms