Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA6L3A6NEY3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA6L3A6NEY3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA6L3A6NEY3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA6L3A6NEY3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms