Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF27A3QJZ7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF27A3QJZ7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF27A3QJZ7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms