Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B9

SUPT16H, FACT complex subunit SPT16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT16HQ9Y5B9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SUPT16HQ9Y5B9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SUPT16HQ9Y5B9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SUPT16HQ9Y5B9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SUPT16HQ9Y5B9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
SUPT16HQ9Y5B9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SUPT16HQ9Y5B9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
SUPT16HQ9Y5B9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SUPT16HQ9Y5B9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SUPT16HQ9Y5B9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SUPT16HQ9Y5B9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
SUPT16HQ9Y5B9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SUPT16HQ9Y5B9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
SUPT16HQ9Y5B9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SUPT16HQ9Y5B9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SUPT16HQ9Y5B9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SUPT16HQ9Y5B9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SUPT16HQ9Y5B9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SUPT16HQ9Y5B9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SUPT16HQ9Y5B9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
SUPT16HQ9Y5B9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SUPT16HQ9Y5B9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SUPT16HQ9Y5B9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SUPT16HQ9Y5B9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
SUPT16HQ9Y5B9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SUPT16HQ9Y5B9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SUPT16HQ9Y5B9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SUPT16HQ9Y5B9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
SUPT16HQ9Y5B9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SUPT16HQ9Y5B9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
SUPT16HQ9Y5B9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SUPT16HQ9Y5B9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SUPT16HQ9Y5B9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SUPT16HQ9Y5B9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SUPT16HQ9Y5B9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SUPT16HQ9Y5B9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SUPT16HQ9Y5B9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SUPT16HQ9Y5B9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.66
SUPT16HQ9Y5B9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SUPT16HQ9Y5B9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SUPT16HQ9Y5B9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
SUPT16HQ9Y5B9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SUPT16HQ9Y5B9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SUPT16HQ9Y5B9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SUPT16HQ9Y5B9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SUPT16HQ9Y5B9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SUPT16HQ9Y5B9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SUPT16HQ9Y5B9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
SUPT16HQ9Y5B9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SUPT16HQ9Y5B9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SUPT16HQ9Y5B9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SUPT16HQ9Y5B9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SUPT16HQ9Y5B9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SUPT16HQ9Y5B9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SUPT16HQ9Y5B9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SUPT16HQ9Y5B9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SUPT16HQ9Y5B9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SUPT16HQ9Y5B9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SUPT16HQ9Y5B9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SUPT16HQ9Y5B9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SUPT16HQ9Y5B9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SUPT16HQ9Y5B9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SUPT16HQ9Y5B9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SUPT16HQ9Y5B9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SUPT16HQ9Y5B9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SUPT16HQ9Y5B9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
SUPT16HQ9Y5B9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SUPT16HQ9Y5B9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SUPT16HQ9Y5B9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SUPT16HQ9Y5B9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SUPT16HQ9Y5B9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SUPT16HQ9Y5B9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SUPT16HQ9Y5B9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SUPT16HQ9Y5B9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SUPT16HQ9Y5B9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SUPT16HQ9Y5B9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SUPT16HQ9Y5B9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SUPT16HQ9Y5B9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SUPT16HQ9Y5B9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SUPT16HQ9Y5B9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SUPT16HQ9Y5B9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SUPT16HQ9Y5B9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SUPT16HQ9Y5B9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SUPT16HQ9Y5B9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SUPT16HQ9Y5B9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SUPT16HQ9Y5B9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SUPT16HQ9Y5B9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SUPT16HQ9Y5B9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SUPT16HQ9Y5B9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SUPT16HQ9Y5B9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
SUPT16HQ9Y5B9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
SUPT16HQ9Y5B9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SUPT16HQ9Y5B9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SUPT16HQ9Y5B9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SUPT16HQ9Y5B9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SUPT16HQ9Y5B9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SUPT16HQ9Y5B9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SUPT16HQ9Y5B9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SUPT16HQ9Y5B9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms