Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3D0

FAM96B, Mitotic spindle-associated MMXD complex subunit MIP18, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM96BQ9Y3D0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM96BQ9Y3D0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM96BQ9Y3D0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM96BQ9Y3D0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM96BQ9Y3D0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM96BQ9Y3D0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM96BQ9Y3D0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM96BQ9Y3D0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM96BQ9Y3D0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM96BQ9Y3D0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM96BQ9Y3D0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM96BQ9Y3D0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM96BQ9Y3D0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM96BQ9Y3D0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM96BQ9Y3D0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM96BQ9Y3D0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM96BQ9Y3D0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM96BQ9Y3D0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM96BQ9Y3D0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM96BQ9Y3D0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM96BQ9Y3D0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM96BQ9Y3D0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM96BQ9Y3D0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM96BQ9Y3D0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM96BQ9Y3D0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM96BQ9Y3D0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM96BQ9Y3D0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM96BQ9Y3D0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM96BQ9Y3D0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM96BQ9Y3D0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM96BQ9Y3D0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM96BQ9Y3D0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM96BQ9Y3D0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM96BQ9Y3D0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM96BQ9Y3D0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM96BQ9Y3D0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM96BQ9Y3D0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM96BQ9Y3D0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM96BQ9Y3D0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM96BQ9Y3D0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM96BQ9Y3D0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM96BQ9Y3D0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM96BQ9Y3D0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM96BQ9Y3D0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM96BQ9Y3D0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM96BQ9Y3D0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM96BQ9Y3D0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM96BQ9Y3D0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM96BQ9Y3D0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM96BQ9Y3D0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM96BQ9Y3D0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM96BQ9Y3D0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM96BQ9Y3D0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM96BQ9Y3D0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM96BQ9Y3D0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM96BQ9Y3D0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM96BQ9Y3D0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM96BQ9Y3D0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM96BQ9Y3D0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM96BQ9Y3D0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM96BQ9Y3D0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM96BQ9Y3D0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM96BQ9Y3D0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM96BQ9Y3D0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM96BQ9Y3D0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM96BQ9Y3D0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM96BQ9Y3D0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM96BQ9Y3D0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM96BQ9Y3D0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM96BQ9Y3D0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM96BQ9Y3D0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM96BQ9Y3D0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM96BQ9Y3D0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM96BQ9Y3D0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM96BQ9Y3D0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM96BQ9Y3D0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM96BQ9Y3D0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM96BQ9Y3D0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM96BQ9Y3D0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM96BQ9Y3D0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM96BQ9Y3D0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM96BQ9Y3D0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM96BQ9Y3D0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM96BQ9Y3D0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM96BQ9Y3D0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM96BQ9Y3D0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM96BQ9Y3D0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM96BQ9Y3D0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM96BQ9Y3D0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM96BQ9Y3D0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM96BQ9Y3D0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM96BQ9Y3D0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM96BQ9Y3D0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM96BQ9Y3D0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM96BQ9Y3D0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM96BQ9Y3D0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM96BQ9Y3D0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM96BQ9Y3D0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM96BQ9Y3D0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM96BQ9Y3D0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms