Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMG5Q9UPR3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMG5Q9UPR3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SMG5Q9UPR3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMG5Q9UPR3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMG5Q9UPR3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SMG5Q9UPR3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SMG5Q9UPR3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SMG5Q9UPR3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SMG5Q9UPR3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SMG5Q9UPR3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMG5Q9UPR3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMG5Q9UPR3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMG5Q9UPR3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMG5Q9UPR3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMG5Q9UPR3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMG5Q9UPR3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMG5Q9UPR3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMG5Q9UPR3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMG5Q9UPR3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMG5Q9UPR3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMG5Q9UPR3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMG5Q9UPR3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMG5Q9UPR3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMG5Q9UPR3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMG5Q9UPR3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMG5Q9UPR3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMG5Q9UPR3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMG5Q9UPR3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMG5Q9UPR3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMG5Q9UPR3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMG5Q9UPR3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMG5Q9UPR3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SMG5Q9UPR3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMG5Q9UPR3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMG5Q9UPR3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMG5Q9UPR3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMG5Q9UPR3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMG5Q9UPR3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMG5Q9UPR3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMG5Q9UPR3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMG5Q9UPR3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMG5Q9UPR3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMG5Q9UPR3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMG5Q9UPR3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SMG5Q9UPR3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMG5Q9UPR3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMG5Q9UPR3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMG5Q9UPR3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMG5Q9UPR3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMG5Q9UPR3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMG5Q9UPR3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMG5Q9UPR3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMG5Q9UPR3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMG5Q9UPR3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMG5Q9UPR3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMG5Q9UPR3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMG5Q9UPR3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMG5Q9UPR3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMG5Q9UPR3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SMG5Q9UPR3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SMG5Q9UPR3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMG5Q9UPR3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMG5Q9UPR3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMG5Q9UPR3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMG5Q9UPR3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMG5Q9UPR3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMG5Q9UPR3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMG5Q9UPR3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMG5Q9UPR3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SMG5Q9UPR3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMG5Q9UPR3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMG5Q9UPR3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMG5Q9UPR3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMG5Q9UPR3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SMG5Q9UPR3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SMG5Q9UPR3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMG5Q9UPR3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMG5Q9UPR3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMG5Q9UPR3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMG5Q9UPR3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMG5Q9UPR3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMG5Q9UPR3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMG5Q9UPR3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMG5Q9UPR3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMG5Q9UPR3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMG5Q9UPR3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMG5Q9UPR3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMG5Q9UPR3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMG5Q9UPR3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMG5Q9UPR3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMG5Q9UPR3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMG5Q9UPR3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMG5Q9UPR3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMG5Q9UPR3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMG5Q9UPR3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMG5Q9UPR3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMG5Q9UPR3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMG5Q9UPR3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMG5Q9UPR3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms