Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GGA2Q9UJY4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
GGA2Q9UJY4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GGA2Q9UJY4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GGA2Q9UJY4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GGA2Q9UJY4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GGA2Q9UJY4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GGA2Q9UJY4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GGA2Q9UJY4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GGA2Q9UJY4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GGA2Q9UJY4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GGA2Q9UJY4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GGA2Q9UJY4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GGA2Q9UJY4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GGA2Q9UJY4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GGA2Q9UJY4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GGA2Q9UJY4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
GGA2Q9UJY4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GGA2Q9UJY4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GGA2Q9UJY4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GGA2Q9UJY4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GGA2Q9UJY4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GGA2Q9UJY4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GGA2Q9UJY4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GGA2Q9UJY4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GGA2Q9UJY4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GGA2Q9UJY4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GGA2Q9UJY4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GGA2Q9UJY4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GGA2Q9UJY4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GGA2Q9UJY4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GGA2Q9UJY4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GGA2Q9UJY4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GGA2Q9UJY4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GGA2Q9UJY4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
GGA2Q9UJY4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GGA2Q9UJY4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GGA2Q9UJY4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GGA2Q9UJY4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GGA2Q9UJY4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GGA2Q9UJY4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GGA2Q9UJY4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GGA2Q9UJY4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GGA2Q9UJY4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GGA2Q9UJY4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GGA2Q9UJY4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GGA2Q9UJY4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GGA2Q9UJY4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GGA2Q9UJY4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GGA2Q9UJY4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GGA2Q9UJY4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GGA2Q9UJY4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GGA2Q9UJY4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
GGA2Q9UJY4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GGA2Q9UJY4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GGA2Q9UJY4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GGA2Q9UJY4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GGA2Q9UJY4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GGA2Q9UJY4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GGA2Q9UJY4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GGA2Q9UJY4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GGA2Q9UJY4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GGA2Q9UJY4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GGA2Q9UJY4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GGA2Q9UJY4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GGA2Q9UJY4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GGA2Q9UJY4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GGA2Q9UJY4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GGA2Q9UJY4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GGA2Q9UJY4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GGA2Q9UJY4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GGA2Q9UJY4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GGA2Q9UJY4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GGA2Q9UJY4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GGA2Q9UJY4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GGA2Q9UJY4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GGA2Q9UJY4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GGA2Q9UJY4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GGA2Q9UJY4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GGA2Q9UJY4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GGA2Q9UJY4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGA2Q9UJY4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GGA2Q9UJY4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GGA2Q9UJY4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GGA2Q9UJY4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GGA2Q9UJY4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GGA2Q9UJY4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GGA2Q9UJY4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GGA2Q9UJY4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GGA2Q9UJY4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GGA2Q9UJY4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GGA2Q9UJY4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GGA2Q9UJY4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GGA2Q9UJY4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GGA2Q9UJY4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GGA2Q9UJY4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GGA2Q9UJY4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GGA2Q9UJY4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GGA2Q9UJY4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GGA2Q9UJY4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms