Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CALCOCO1Q9P1Z2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CALCOCO1Q9P1Z2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CALCOCO1Q9P1Z2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CALCOCO1Q9P1Z2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CALCOCO1Q9P1Z2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CALCOCO1Q9P1Z2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CALCOCO1Q9P1Z2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CALCOCO1Q9P1Z2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CALCOCO1Q9P1Z2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CALCOCO1Q9P1Z2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CALCOCO1Q9P1Z2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CALCOCO1Q9P1Z2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CALCOCO1Q9P1Z2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CALCOCO1Q9P1Z2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CALCOCO1Q9P1Z2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CALCOCO1Q9P1Z2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CALCOCO1Q9P1Z2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CALCOCO1Q9P1Z2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CALCOCO1Q9P1Z2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CALCOCO1Q9P1Z2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CALCOCO1Q9P1Z2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CALCOCO1Q9P1Z2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CALCOCO1Q9P1Z2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CALCOCO1Q9P1Z2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CALCOCO1Q9P1Z2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CALCOCO1Q9P1Z2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CALCOCO1Q9P1Z2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CALCOCO1Q9P1Z2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CALCOCO1Q9P1Z2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CALCOCO1Q9P1Z2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CALCOCO1Q9P1Z2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CALCOCO1Q9P1Z2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CALCOCO1Q9P1Z2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CALCOCO1Q9P1Z2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CALCOCO1Q9P1Z2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CALCOCO1Q9P1Z2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CALCOCO1Q9P1Z2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CALCOCO1Q9P1Z2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CALCOCO1Q9P1Z2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CALCOCO1Q9P1Z2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CALCOCO1Q9P1Z2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CALCOCO1Q9P1Z2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CALCOCO1Q9P1Z2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CALCOCO1Q9P1Z2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CALCOCO1Q9P1Z2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CALCOCO1Q9P1Z2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CALCOCO1Q9P1Z2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CALCOCO1Q9P1Z2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CALCOCO1Q9P1Z2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CALCOCO1Q9P1Z2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CALCOCO1Q9P1Z2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CALCOCO1Q9P1Z2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CALCOCO1Q9P1Z2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CALCOCO1Q9P1Z2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CALCOCO1Q9P1Z2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CALCOCO1Q9P1Z2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CALCOCO1Q9P1Z2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CALCOCO1Q9P1Z2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CALCOCO1Q9P1Z2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CALCOCO1Q9P1Z2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CALCOCO1Q9P1Z2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CALCOCO1Q9P1Z2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CALCOCO1Q9P1Z2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CALCOCO1Q9P1Z2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CALCOCO1Q9P1Z2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CALCOCO1Q9P1Z2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CALCOCO1Q9P1Z2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CALCOCO1Q9P1Z2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CALCOCO1Q9P1Z2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CALCOCO1Q9P1Z2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CALCOCO1Q9P1Z2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CALCOCO1Q9P1Z2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CALCOCO1Q9P1Z2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CALCOCO1Q9P1Z2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CALCOCO1Q9P1Z2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CALCOCO1Q9P1Z2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CALCOCO1Q9P1Z2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CALCOCO1Q9P1Z2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CALCOCO1Q9P1Z2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms