Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZP6

NPAP1, Nuclear pore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAP1Q9NZP6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPAP1Q9NZP6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NPAP1Q9NZP6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPAP1Q9NZP6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPAP1Q9NZP6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPAP1Q9NZP6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPAP1Q9NZP6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPAP1Q9NZP6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPAP1Q9NZP6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPAP1Q9NZP6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPAP1Q9NZP6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPAP1Q9NZP6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPAP1Q9NZP6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPAP1Q9NZP6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPAP1Q9NZP6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NPAP1Q9NZP6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPAP1Q9NZP6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPAP1Q9NZP6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPAP1Q9NZP6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPAP1Q9NZP6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPAP1Q9NZP6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPAP1Q9NZP6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPAP1Q9NZP6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPAP1Q9NZP6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPAP1Q9NZP6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPAP1Q9NZP6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPAP1Q9NZP6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NPAP1Q9NZP6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPAP1Q9NZP6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NPAP1Q9NZP6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPAP1Q9NZP6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPAP1Q9NZP6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPAP1Q9NZP6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPAP1Q9NZP6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPAP1Q9NZP6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPAP1Q9NZP6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPAP1Q9NZP6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPAP1Q9NZP6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPAP1Q9NZP6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPAP1Q9NZP6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPAP1Q9NZP6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPAP1Q9NZP6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPAP1Q9NZP6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NPAP1Q9NZP6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NPAP1Q9NZP6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPAP1Q9NZP6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPAP1Q9NZP6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPAP1Q9NZP6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPAP1Q9NZP6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPAP1Q9NZP6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPAP1Q9NZP6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPAP1Q9NZP6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPAP1Q9NZP6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPAP1Q9NZP6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPAP1Q9NZP6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPAP1Q9NZP6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPAP1Q9NZP6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPAP1Q9NZP6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPAP1Q9NZP6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPAP1Q9NZP6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPAP1Q9NZP6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPAP1Q9NZP6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPAP1Q9NZP6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPAP1Q9NZP6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPAP1Q9NZP6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPAP1Q9NZP6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPAP1Q9NZP6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPAP1Q9NZP6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NPAP1Q9NZP6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPAP1Q9NZP6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPAP1Q9NZP6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPAP1Q9NZP6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPAP1Q9NZP6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPAP1Q9NZP6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPAP1Q9NZP6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPAP1Q9NZP6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPAP1Q9NZP6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPAP1Q9NZP6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPAP1Q9NZP6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPAP1Q9NZP6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPAP1Q9NZP6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPAP1Q9NZP6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPAP1Q9NZP6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPAP1Q9NZP6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPAP1Q9NZP6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPAP1Q9NZP6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPAP1Q9NZP6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPAP1Q9NZP6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPAP1Q9NZP6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPAP1Q9NZP6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPAP1Q9NZP6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPAP1Q9NZP6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPAP1Q9NZP6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPAP1Q9NZP6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPAP1Q9NZP6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPAP1Q9NZP6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPAP1Q9NZP6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPAP1Q9NZP6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NPAP1Q9NZP6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPAP1Q9NZP6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms