Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TBCCD1Q9NVR7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TBCCD1Q9NVR7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TBCCD1Q9NVR7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TBCCD1Q9NVR7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TBCCD1Q9NVR7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TBCCD1Q9NVR7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TBCCD1Q9NVR7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TBCCD1Q9NVR7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TBCCD1Q9NVR7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBCCD1Q9NVR7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TBCCD1Q9NVR7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TBCCD1Q9NVR7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TBCCD1Q9NVR7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TBCCD1Q9NVR7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TBCCD1Q9NVR7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TBCCD1Q9NVR7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TBCCD1Q9NVR7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBCCD1Q9NVR7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBCCD1Q9NVR7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBCCD1Q9NVR7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TBCCD1Q9NVR7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBCCD1Q9NVR7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBCCD1Q9NVR7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TBCCD1Q9NVR7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TBCCD1Q9NVR7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TBCCD1Q9NVR7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TBCCD1Q9NVR7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TBCCD1Q9NVR7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TBCCD1Q9NVR7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TBCCD1Q9NVR7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TBCCD1Q9NVR7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TBCCD1Q9NVR7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TBCCD1Q9NVR7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TBCCD1Q9NVR7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TBCCD1Q9NVR7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TBCCD1Q9NVR7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TBCCD1Q9NVR7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TBCCD1Q9NVR7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TBCCD1Q9NVR7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TBCCD1Q9NVR7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TBCCD1Q9NVR7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TBCCD1Q9NVR7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TBCCD1Q9NVR7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TBCCD1Q9NVR7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TBCCD1Q9NVR7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TBCCD1Q9NVR7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TBCCD1Q9NVR7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TBCCD1Q9NVR7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TBCCD1Q9NVR7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TBCCD1Q9NVR7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TBCCD1Q9NVR7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TBCCD1Q9NVR7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TBCCD1Q9NVR7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TBCCD1Q9NVR7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TBCCD1Q9NVR7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TBCCD1Q9NVR7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TBCCD1Q9NVR7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TBCCD1Q9NVR7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TBCCD1Q9NVR7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TBCCD1Q9NVR7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TBCCD1Q9NVR7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TBCCD1Q9NVR7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TBCCD1Q9NVR7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TBCCD1Q9NVR7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TBCCD1Q9NVR7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TBCCD1Q9NVR7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TBCCD1Q9NVR7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TBCCD1Q9NVR7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TBCCD1Q9NVR7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TBCCD1Q9NVR7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TBCCD1Q9NVR7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TBCCD1Q9NVR7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TBCCD1Q9NVR7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TBCCD1Q9NVR7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TBCCD1Q9NVR7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TBCCD1Q9NVR7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TBCCD1Q9NVR7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TBCCD1Q9NVR7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TBCCD1Q9NVR7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TBCCD1Q9NVR7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TBCCD1Q9NVR7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TBCCD1Q9NVR7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TBCCD1Q9NVR7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TBCCD1Q9NVR7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TBCCD1Q9NVR7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TBCCD1Q9NVR7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TBCCD1Q9NVR7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TBCCD1Q9NVR7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TBCCD1Q9NVR7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TBCCD1Q9NVR7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBCCD1Q9NVR7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBCCD1Q9NVR7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TBCCD1Q9NVR7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TBCCD1Q9NVR7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBCCD1Q9NVR7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TBCCD1Q9NVR7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBCCD1Q9NVR7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBCCD1Q9NVR7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBCCD1Q9NVR7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms