Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP26Q9NRE1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP26Q9NRE1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP26Q9NRE1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MMP26Q9NRE1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP26Q9NRE1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP26Q9NRE1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMP26Q9NRE1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MMP26Q9NRE1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MMP26Q9NRE1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP26Q9NRE1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP26Q9NRE1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP26Q9NRE1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP26Q9NRE1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP26Q9NRE1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP26Q9NRE1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP26Q9NRE1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP26Q9NRE1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP26Q9NRE1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP26Q9NRE1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP26Q9NRE1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP26Q9NRE1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP26Q9NRE1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP26Q9NRE1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP26Q9NRE1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP26Q9NRE1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP26Q9NRE1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP26Q9NRE1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP26Q9NRE1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP26Q9NRE1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP26Q9NRE1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP26Q9NRE1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP26Q9NRE1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP26Q9NRE1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP26Q9NRE1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP26Q9NRE1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP26Q9NRE1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP26Q9NRE1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP26Q9NRE1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP26Q9NRE1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP26Q9NRE1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP26Q9NRE1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP26Q9NRE1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP26Q9NRE1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP26Q9NRE1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP26Q9NRE1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP26Q9NRE1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP26Q9NRE1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP26Q9NRE1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP26Q9NRE1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMP26Q9NRE1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP26Q9NRE1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP26Q9NRE1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP26Q9NRE1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP26Q9NRE1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP26Q9NRE1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MMP26Q9NRE1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP26Q9NRE1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP26Q9NRE1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP26Q9NRE1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP26Q9NRE1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP26Q9NRE1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP26Q9NRE1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MMP26Q9NRE1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP26Q9NRE1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP26Q9NRE1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP26Q9NRE1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP26Q9NRE1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP26Q9NRE1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP26Q9NRE1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MMP26Q9NRE1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP26Q9NRE1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP26Q9NRE1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP26Q9NRE1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP26Q9NRE1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP26Q9NRE1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP26Q9NRE1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP26Q9NRE1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP26Q9NRE1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP26Q9NRE1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP26Q9NRE1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP26Q9NRE1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP26Q9NRE1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP26Q9NRE1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP26Q9NRE1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP26Q9NRE1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP26Q9NRE1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP26Q9NRE1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP26Q9NRE1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP26Q9NRE1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP26Q9NRE1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP26Q9NRE1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP26Q9NRE1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP26Q9NRE1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP26Q9NRE1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP26Q9NRE1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP26Q9NRE1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP26Q9NRE1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP26Q9NRE1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP26Q9NRE1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms