Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR30

DDX21, Nucleolar RNA helicase 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 783 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX21Q9NR30 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.323e-8■■■■■ 62.1
DDX21Q9NR30 AC015845.2-202ENST00000580960 505 ntTSL 215.03■□□□□ -03e-8■■■■■ 62.1
DDX21Q9NR30 AC093496.1-201ENST00000525575 613 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.153e-8■■■■■ 62.1
DDX21Q9NR30 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.323e-8■■■■■ 62.1
DDX21Q9NR30 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.343e-8■■■■■ 62.1
DDX21Q9NR30 HFM1-204ENST00000448819 540 ntTSL 512.26□□□□□ -0.456e-18■■■■■ 61.7
DDX21Q9NR30 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 55.78□□□□□ -1.486e-18■■■■■ 61.7
DDX21Q9NR30 HFM1-208ENST00000488023 1699 ntTSL 54.45□□□□□ -1.76e-18■■■■■ 61.7
DDX21Q9NR30 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 54.11□□□□□ -1.756e-18■■■■■ 61.7
DDX21Q9NR30 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.126e-18■■■■■ 61.7
DDX21Q9NR30 FAM178B-205ENST00000494172 592 ntTSL 323.36■■□□□ 1.339e-8■■■■■ 58.5
DDX21Q9NR30 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.019e-8■■■■■ 58.5
DDX21Q9NR30 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.289e-8■■■■■ 58.5
DDX21Q9NR30 FAM178B-202ENST00000470789 722 ntTSL 1 (best)14.77□□□□□ -0.059e-8■■■■■ 58.5
DDX21Q9NR30 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.562e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-215ENST00000631193 991 ntTSL 520.83■□□□□ 0.932e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.692e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-203ENST00000460750 4738 ntTSL 1 (best)18.53■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 RORC-201ENST00000318247 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-210ENST00000490363 4065 ntTSL 515.78■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 RORC-202ENST00000356728 3050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 RORC-204ENST00000638901 2326 ntTSL 212.95□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.291e-6■■■■■ 49.7
DDX21Q9NR30 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.671e-6■■■■■ 49.7
DDX21Q9NR30 ZNF707-212ENST00000527561 1252 ntTSL 220.83■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 49.7
DDX21Q9NR30 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 49.7
DDX21Q9NR30 TECTA-202ENST00000392793 7426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 49.7
DDX21Q9NR30 AC012560.1-202ENST00000421324 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 49.7
DDX21Q9NR30 POM121L2-201ENST00000429945 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 35.09□□□□□ -1.591e-6■■■■■ 49.7
DDX21Q9NR30 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.174e-7■■■■■ 46.8
DDX21Q9NR30 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.82e-6■■■■■ 46.1
DDX21Q9NR30 STRBP-203ENST00000407982 2751 ntTSL 1 (best)23.85■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 46.1
DDX21Q9NR30 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.162e-6■■■■■ 46.1
DDX21Q9NR30 DENND3-205ENST00000518198 1848 ntTSL 231.54■■■□□ 2.647e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 DENND3-219ENST00000523058 906 ntTSL 331.18■■■□□ 2.587e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 DENND3-215ENST00000520986 899 ntTSL 230.8■■■□□ 2.527e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.257e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.067e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.047e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.167e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.947e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 DENND3-210ENST00000519291 560 ntTSL 420.19■□□□□ 0.827e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.717e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.697e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.637e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.587e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 TBXAS1-207ENST00000438104 752 ntTSL 516.44■□□□□ 0.227e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 DENND3-208ENST00000518668 5185 ntTSL 516.27■□□□□ 0.197e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 ACRBP-202ENST00000414226 1700 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.187e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.117e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 MIR99AHG-214ENST00000602580 560 ntTSL 514.85□□□□□ -0.037e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 MIR99AHG-220ENST00000635845 1588 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.057e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.117e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.119e-11■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 MIR99AHG-201ENST00000400178 700 ntTSL 314.22□□□□□ -0.137e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 MTRNR2L4-201ENST00000399974 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.187e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 U3.46-201ENST00000365612 216 ntBASIC13.51□□□□□ -0.257e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 NSD3-202ENST00000317025 10776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.327e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 ACRBP-207ENST00000542357 838 ntTSL 512.4□□□□□ -0.427e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 PTPRD-207ENST00000463477 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.447e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 NCAPG2-203ENST00000409423 3957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.479e-11■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 U3.18-201ENST00000390880 216 ntBASIC10.23□□□□□ -0.777e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 NCAPG2-206ENST00000467785 3276 ntTSL 1 (best)10.08□□□□□ -0.89e-11■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 MIR99AHG-209ENST00000456342 648 ntTSL 210.01□□□□□ -0.817e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 NCAPG2-205ENST00000441982 2926 ntTSL 29.98□□□□□ -0.819e-11■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 NCAPG2-204ENST00000432615 4134 ntTSL 59.69□□□□□ -0.869e-11■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.987e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -17e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 MIR99AHG-218ENST00000602935 554 ntTSL 58.74□□□□□ -1.017e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.189e-11■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 CACHD1-204ENST00000495994 5547 ntTSL 1 (best)7.5□□□□□ -1.217e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 CACHD1-202ENST00000470527 5260 ntTSL 1 (best)7.21□□□□□ -1.267e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.467e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.577e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 SMAD1-203ENST00000502342 262 ntTSL 32.96□□□□□ -1.947e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)26.77■■□□□ 1.886e-9■■■■■ 42.6
DDX21Q9NR30 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.356e-9■■■■■ 42.6
DDX21Q9NR30 CTNNA3-204ENST00000494580 470 ntTSL 36.52□□□□□ -1.373e-8■■■■■ 41.5
DDX21Q9NR30 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.573e-8■■■■■ 41.5
DDX21Q9NR30 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.054e-7■■■■■ 41.4
DDX21Q9NR30 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.314e-7■■■■■ 41.4
DDX21Q9NR30 SORCS2-204ENST00000511199 532 ntTSL 411.36□□□□□ -0.594e-7■■■■■ 41.4
DDX21Q9NR30 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.085e-7■■■■■ 41.3
DDX21Q9NR30 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.985e-7■■■■■ 41.3
DDX21Q9NR30 PTP4A3-205ENST00000523147 558 ntTSL 527.26■■□□□ 1.955e-7■■■■■ 41.3
DDX21Q9NR30 STXBP3-202ENST00000469338 294 ntTSL 223.07■■□□□ 1.285e-44■■■■■ 40.4
DDX21Q9NR30 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.286e-10■■■■■ 40.4
DDX21Q9NR30 STXBP3-204ENST00000483586 561 ntTSL 221.7■■□□□ 1.065e-44■■■■■ 40.4
DDX21Q9NR30 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.935e-44■■■■■ 40.4
DDX21Q9NR30 CDHR5-207ENST00000531177 2816 ntTSL 218.96■□□□□ 0.636e-10■■■■■ 40.4
DDX21Q9NR30 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.26e-10■■■■■ 40.4
DDX21Q9NR30 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.016e-10■■■■■ 40.4
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