Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR30

DDX21, Nucleolar RNA helicase 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 783 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX21Q9NR30 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.227e-7■■■■■ 912.3
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DDX21Q9NR30 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 223.9■■□□□ 1.421e-26■■■■■ 198.7
DDX21Q9NR30 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 222.79■■□□□ 1.241e-26■■■■■ 198.7
DDX21Q9NR30 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.811e-26■■■■■ 198.7
DDX21Q9NR30 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.421e-26■■■■■ 198.7
DDX21Q9NR30 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.121e-26■■■■■ 198.7
DDX21Q9NR30 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.471e-26■■■■■ 198.7
DDX21Q9NR30 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 311.79□□□□□ -0.521e-26■■■■■ 198.7
DDX21Q9NR30 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 511.7□□□□□ -0.541e-26■■■■■ 198.7
DDX21Q9NR30 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 39.65□□□□□ -0.861e-26■■■■■ 198.7
DDX21Q9NR30 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 45.29□□□□□ -1.561e-26■■■■■ 198.7
DDX21Q9NR30 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 54.82□□□□□ -1.641e-26■■■■■ 198.7
DDX21Q9NR30 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 54.3□□□□□ -1.721e-26■■■■■ 198.7
DDX21Q9NR30 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.77□□□□□ -2.131e-26■■■■■ 198.7
DDX21Q9NR30 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC17.98■□□□□ 0.471e-36■■■■■ 138.5
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DDX21Q9NR30 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt14.08□□□□□ -0.161e-36■■■■■ 138.5
DDX21Q9NR30 GALNT1-206ENST00000591924 542 ntTSL 328.74■■■□□ 2.195e-33■■■■■ 127.3
DDX21Q9NR30 GALNT1-202ENST00000586725 272 ntTSL 518.91■□□□□ 0.625e-33■■■■■ 127.3
DDX21Q9NR30 U3.38-201ENST00000408534 216 ntBASIC11.47□□□□□ -0.576e-15■■■■■ 111.8
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DDX21Q9NR30 ARMC3-202ENST00000376528 3258 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.744e-14■■■■■ 105.5
DDX21Q9NR30 ARMC3-204ENST00000409983 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.754e-14■■■■■ 105.5
DDX21Q9NR30 ARMC3-203ENST00000409049 2479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.974e-14■■■■■ 105.5
DDX21Q9NR30 ARMC3-211ENST00000484642 974 ntTSL 55.14□□□□□ -1.594e-14■■■■■ 105.5
DDX21Q9NR30 ARMC3-213ENST00000496741 572 ntTSL 44.8□□□□□ -1.644e-14■■■■■ 105.5
DDX21Q9NR30 TEX101-203ENST00000602198 1446 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.043e-13■■■■■ 99.3
DDX21Q9NR30 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.992e-12■■■■■ 93.1
DDX21Q9NR30 KCTD8-202ENST00000515268 464 ntTSL 33.11□□□□□ -1.912e-12■■■■■ 93.1
DDX21Q9NR30 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.432e-11■■■■■ 89
DDX21Q9NR30 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.352e-11■■■■■ 89
DDX21Q9NR30 MIR663AHG-228ENST00000608487 486 ntTSL 529.75■■■□□ 2.352e-11■■■■■ 89
DDX21Q9NR30 MIR663AHG-222ENST00000600263 751 ntTSL 529.75■■■□□ 2.352e-11■■■■■ 89
DDX21Q9NR30 MIR663AHG-206ENST00000594150 693 ntTSL 528.65■■■□□ 2.182e-11■■■■■ 89
DDX21Q9NR30 MIR663AHG-216ENST00000597979 568 ntTSL 527.55■■■□□ 22e-11■■■■■ 89
DDX21Q9NR30 MIR663AHG-235ENST00000609914 644 ntTSL 522.94■■□□□ 1.262e-11■■■■■ 89
DDX21Q9NR30 MIR663AHG-205ENST00000594135 654 ntTSL 522.94■■□□□ 1.262e-11■■■■■ 89
DDX21Q9NR30 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.622e-11■■■■■ 89
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DDX21Q9NR30 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.782e-11■■■■■ 89
DDX21Q9NR30 TEX11-203ENST00000374333 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.611e-11■■■■■ 86.9
DDX21Q9NR30 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.871e-11■■■■■ 86.9
DDX21Q9NR30 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.481e-11■■■■■ 86.9
DDX21Q9NR30 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.56□□□□□ -1.841e-11■■■■■ 86.9
DDX21Q9NR30 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.97□□□□□ -2.091e-11■■■■■ 86.9
DDX21Q9NR30 VPS13B-206ENST00000496144 5625 ntTSL 510.53□□□□□ -0.722e-21■■■■■ 83.8
DDX21Q9NR30 VPS13B-211ENST00000522802 570 ntTSL 38.68□□□□□ -1.022e-21■■■■■ 83.8
DDX21Q9NR30 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.262e-21■■■■■ 83.8
DDX21Q9NR30 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.322e-21■■■■■ 83.8
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DDX21Q9NR30 MIR663AHG-214ENST00000597267 653 ntTSL 531.61■■■□□ 2.654e-11■■■■■ 82.3
DDX21Q9NR30 MIR663AHG-229ENST00000608521 553 ntTSL 527.08■■□□□ 1.934e-11■■■■■ 82.3
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DDX21Q9NR30 MIR663AHG-219ENST00000598451 511 ntTSL 517.84■□□□□ 0.454e-11■■■■■ 82.3
DDX21Q9NR30 MIR663AHG-218ENST00000598448 804 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.074e-11■■■■■ 82.3
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DDX21Q9NR30 NME4-209ENST00000460297 1652 ntTSL 530.93■■■□□ 2.549e-11■■■■■ 80.7
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DDX21Q9NR30 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.119e-11■■■■■ 80.7
DDX21Q9NR30 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.119e-11■■■■■ 80.7
DDX21Q9NR30 NME4-205ENST00000444498 1111 ntTSL 324.37■■□□□ 1.499e-11■■■■■ 80.7
DDX21Q9NR30 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.239e-11■■■■■ 80.7
DDX21Q9NR30 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.859e-11■■■■■ 80.7
DDX21Q9NR30 NME4-208ENST00000454619 719 ntTSL 518.91■□□□□ 0.629e-11■■■■■ 80.7
DDX21Q9NR30 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.469e-11■■■■■ 80.7
DDX21Q9NR30 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC5.07□□□□□ -1.69e-11■■■■■ 80.7
DDX21Q9NR30 MIR663AHG-217ENST00000598150 751 ntTSL 520.86■□□□□ 0.931e-11■■■■■ 76.7
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DDX21Q9NR30 MIR663AHG-226ENST00000601901 644 ntTSL 516.59■□□□□ 0.251e-11■■■■■ 75.8
DDX21Q9NR30 MIR663AHG-204ENST00000594130 628 ntTSL 516.11■□□□□ 0.171e-11■■■■■ 75.8
DDX21Q9NR30 MIR663AHG-234ENST00000609687 697 ntTSL 515.81■□□□□ 0.121e-11■■■■■ 75.8
DDX21Q9NR30 MIR663AHG-208ENST00000596058 665 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.161e-11■■■■■ 75.8
DDX21Q9NR30 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.871e-11■■■■■ 75.8
DDX21Q9NR30 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.066e-10■■■■■ 74.5
DDX21Q9NR30 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.86e-10■■■■■ 74.5
DDX21Q9NR30 FBP1-202ENST00000414122 629 ntTSL 516.75■□□□□ 0.276e-10■■■■■ 74.5
DDX21Q9NR30 MIR663AHG-223ENST00000601079 613 ntTSL 529.66■■■□□ 2.341e-11■■■■■ 70.8
DDX21Q9NR30 MIR663AHG-236ENST00000610014 475 ntTSL 525.97■■□□□ 1.751e-11■■■■■ 70.8
DDX21Q9NR30 MIR663AHG-221ENST00000600225 473 ntTSL 518.41■□□□□ 0.541e-11■■■■■ 70.8
DDX21Q9NR30 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.834e-9■■■■■ 68.3
DDX21Q9NR30 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.634e-9■■■■■ 68.3
DDX21Q9NR30 TH2LCRR-204ENST00000458509 407 ntTSL 1 (best)28.89■■■□□ 2.224e-9■■■■■ 68.3
DDX21Q9NR30 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.394e-9■■■■■ 68.3
DDX21Q9NR30 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.163e-17■■■■■ 68.3
DDX21Q9NR30 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC13.53□□□□□ -0.243e-17■■■■■ 68.3
DDX21Q9NR30 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.054e-9■■■■■ 68.3
DDX21Q9NR30 TH2LCRR-201ENST00000417516 390 ntTSL 28.31□□□□□ -1.084e-9■■■■■ 68.3
DDX21Q9NR30 KPNA4-203ENST00000483437 510 ntTSL 55.16□□□□□ -1.583e-17■■■■■ 68.3
DDX21Q9NR30 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.138e-8■■■■■ 65.2
DDX21Q9NR30 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.226e-8■■■■■ 65.1
DDX21Q9NR30 RPTOR-209ENST00000575542 5536 ntTSL 1 (best)17.86■□□□□ 0.453e-8■■■■■ 62.1
DDX21Q9NR30 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.323e-8■■■■■ 62.1
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