RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520986.5

DENND3-215, Transcript of DENN domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene DENND3, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND3-215ENST00000520986 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.81■■■■■ 6.85
DENND3-215ENST00000520986 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.4■■■■■ 5.82
DENND3-215ENST00000520986 ABCC9O60706 1549 aa50.29■■■■■ 5.64
DENND3-215ENST00000520986 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.36■■■■■ 5.33
DENND3-215ENST00000520986 NACADO15069 1562 aa48.3■■■■■ 5.32
DENND3-215ENST00000520986 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.25■■■■■ 5.31
DENND3-215ENST00000520986 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.16■■■■■ 5.3
DENND3-215ENST00000520986 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.02■■■■■ 5.28
DENND3-215ENST00000520986 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.81■■■■■ 5.24
DENND3-215ENST00000520986 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.33■■■■■ 5.17
DENND3-215ENST00000520986 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.98■■■■■ 5.11
DENND3-215ENST00000520986 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.94■■■■■ 5.11
DENND3-215ENST00000520986 SCRIBQ14160 1630 aa46.91■■■■■ 5.1
DENND3-215ENST00000520986 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.38■■■■■ 5.02
DENND3-215ENST00000520986 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.17■■■■■ 4.98
DENND3-215ENST00000520986 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.68■■■■■ 4.9
DENND3-215ENST00000520986 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.5■■■■■ 4.87
DENND3-215ENST00000520986 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.17■■■■■ 4.82
DENND3-215ENST00000520986 SMARCA4P51532 1647 aa44.87■■■■■ 4.77
DENND3-215ENST00000520986 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.8■■■■■ 4.76
DENND3-215ENST00000520986 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.61■■■■■ 4.73
DENND3-215ENST00000520986 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.57■■■■■ 4.73
DENND3-215ENST00000520986 NCAPD3P42695 1498 aa44.57■■■■■ 4.73
DENND3-215ENST00000520986 SMARCA2P51531 1590 aa44.54■■■■■ 4.72
DENND3-215ENST00000520986 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.43■■■■■ 4.7
DENND3-215ENST00000520986 HMGXB3Q12766 1538 aa44.36■■■■■ 4.69
DENND3-215ENST00000520986 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.23■■■■■ 4.67
DENND3-215ENST00000520986 WIZO95785 1651 aa44.1■■■■■ 4.65
DENND3-215ENST00000520986 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.05■■■■■ 4.64
DENND3-215ENST00000520986 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.62■■■■■ 4.57
DENND3-215ENST00000520986 NESP48681 1621 aa43.54■■■■■ 4.56
DENND3-215ENST00000520986 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.4■■■■■ 4.54
DENND3-215ENST00000520986 ERCC6Q03468 1493 aa43.32■■■■■ 4.52
DENND3-215ENST00000520986 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.27■■■■■ 4.52
DENND3-215ENST00000520986 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.1■■■■■ 4.49
DENND3-215ENST00000520986 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.07■■■■■ 4.49
DENND3-215ENST00000520986 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.04■■■■■ 4.48
DENND3-215ENST00000520986 CFTRP13569 1480 aa43.03■■■■■ 4.48
DENND3-215ENST00000520986 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
DENND3-215ENST00000520986 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.45
DENND3-215ENST00000520986 CUX2O14529 1486 aa42.87■■■■■ 4.45
DENND3-215ENST00000520986 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.79■■■■■ 4.44
DENND3-215ENST00000520986 PRDM2Q13029 1718 aa42.74■■■■■ 4.43
DENND3-215ENST00000520986 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.73■■■■■ 4.43
DENND3-215ENST00000520986 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.67■■■■■ 4.42
DENND3-215ENST00000520986 WDR62O43379 1518 aa42.55■■■■■ 4.4
DENND3-215ENST00000520986 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.37
DENND3-215ENST00000520986 TOPBP1Q92547 1522 aa42.12■■■■■ 4.33
DENND3-215ENST00000520986 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.09■■■■■ 4.33
DENND3-215ENST00000520986 ABCC8Q09428 1581 aa42.07■■■■■ 4.33
DENND3-215ENST00000520986 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.06■■■■■ 4.32
DENND3-215ENST00000520986 IFT140Q96RY7 1462 aa41.82■■■■■ 4.29
DENND3-215ENST00000520986 CUX1P39880 1505 aa41.81■■■■■ 4.28
DENND3-215ENST00000520986 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
DENND3-215ENST00000520986 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
DENND3-215ENST00000520986 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
DENND3-215ENST00000520986 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.66■■■■■ 4.26
DENND3-215ENST00000520986 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.59■■■■■ 4.25
DENND3-215ENST00000520986 SOGA1O94964 1423 aa41.56■■■■■ 4.24
DENND3-215ENST00000520986 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.52■■■■■ 4.24
DENND3-215ENST00000520986 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
DENND3-215ENST00000520986 SYNJ1O43426 1573 aa41.46■■■■■ 4.23
DENND3-215ENST00000520986 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.45■■■■■ 4.23
DENND3-215ENST00000520986 TOP2BQ02880 1626 aa41.44■■■■■ 4.22
DENND3-215ENST00000520986 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.41■■■■■ 4.22
DENND3-215ENST00000520986 WDR97A6NE52 1622 aa41.35■■■■■ 4.21
DENND3-215ENST00000520986 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
DENND3-215ENST00000520986 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.24■■■■■ 4.19
DENND3-215ENST00000520986 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.11■■■■■ 4.17
DENND3-215ENST00000520986 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.09■■■■■ 4.17
DENND3-215ENST00000520986 GRIN2BQ13224 1484 aa41.08■■■■■ 4.17
DENND3-215ENST00000520986 OSCARQ8IYS5 282 aa41.06■■■■■ 4.16
DENND3-215ENST00000520986 PBRM1Q86U86 1689 aa41.04■■■■■ 4.16
DENND3-215ENST00000520986 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.04■■■■■ 4.16
DENND3-215ENST00000520986 CHD1O14646 1710 aa41■■■■■ 4.15
DENND3-215ENST00000520986 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
DENND3-215ENST00000520986 FBLN2P98095 1184 aa40.88■■■■■ 4.13
DENND3-215ENST00000520986 SYNJ2O15056 1496 aa40.82■■■■■ 4.12
DENND3-215ENST00000520986 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
DENND3-215ENST00000520986 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.75■■■■■ 4.11
DENND3-215ENST00000520986 ADAMTS12P58397 1594 aa40.71■■■■■ 4.11
DENND3-215ENST00000520986 KIF27Q86VH2 1401 aa40.64■■■■■ 4.1
DENND3-215ENST00000520986 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.61■■■■■ 4.09
DENND3-215ENST00000520986 GRIN2AQ12879 1464 aa40.57■■■■■ 4.08
DENND3-215ENST00000520986 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.54■■■■■ 4.08
DENND3-215ENST00000520986 TRIM41Q8WV44 630 aa40.51■■■■■ 4.08
DENND3-215ENST00000520986 IGF1RP08069 1367 aa40.48■■■■■ 4.07
DENND3-215ENST00000520986 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.46■■■■■ 4.07
DENND3-215ENST00000520986 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.46■■■■■ 4.07
DENND3-215ENST00000520986 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.46■■■■■ 4.07
DENND3-215ENST00000520986 ARHGEF11O15085 1522 aa40.45■■■■■ 4.07
DENND3-215ENST00000520986 CUL7Q14999 1698 aa40.39■■■■■ 4.06
DENND3-215ENST00000520986 NUP160Q12769 1436 aa40.39■■■■■ 4.06
DENND3-215ENST00000520986 CEP170Q5SW79 1584 aa40.39■■■■■ 4.06
DENND3-215ENST00000520986 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.32■■■■■ 4.05
DENND3-215ENST00000520986 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.23■■■■■ 4.03
DENND3-215ENST00000520986 ARAP1Q96P48 1450 aa40.13■■■■■ 4.01
DENND3-215ENST00000520986 SHROOM2Q13796 1616 aa40.1■■■■■ 4.01
DENND3-215ENST00000520986 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.05■■■■■ 4
DENND3-215ENST00000520986 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.04■■■■■ 4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms