Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCB9Q9NP78 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCB9Q9NP78 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCB9Q9NP78 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB9Q9NP78 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB9Q9NP78 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB9Q9NP78 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCB9Q9NP78 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCB9Q9NP78 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCB9Q9NP78 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCB9Q9NP78 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCB9Q9NP78 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCB9Q9NP78 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCB9Q9NP78 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCB9Q9NP78 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCB9Q9NP78 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB9Q9NP78 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB9Q9NP78 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCB9Q9NP78 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB9Q9NP78 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCB9Q9NP78 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB9Q9NP78 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCB9Q9NP78 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCB9Q9NP78 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB9Q9NP78 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB9Q9NP78 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCB9Q9NP78 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB9Q9NP78 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB9Q9NP78 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB9Q9NP78 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB9Q9NP78 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB9Q9NP78 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB9Q9NP78 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB9Q9NP78 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB9Q9NP78 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB9Q9NP78 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB9Q9NP78 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB9Q9NP78 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB9Q9NP78 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ABCB9Q9NP78 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ABCB9Q9NP78 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB9Q9NP78 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB9Q9NP78 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB9Q9NP78 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB9Q9NP78 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB9Q9NP78 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB9Q9NP78 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB9Q9NP78 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB9Q9NP78 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB9Q9NP78 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB9Q9NP78 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB9Q9NP78 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB9Q9NP78 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB9Q9NP78 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB9Q9NP78 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCB9Q9NP78 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCB9Q9NP78 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCB9Q9NP78 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCB9Q9NP78 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCB9Q9NP78 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCB9Q9NP78 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCB9Q9NP78 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCB9Q9NP78 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCB9Q9NP78 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCB9Q9NP78 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCB9Q9NP78 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCB9Q9NP78 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCB9Q9NP78 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCB9Q9NP78 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB9Q9NP78 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB9Q9NP78 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB9Q9NP78 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB9Q9NP78 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB9Q9NP78 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB9Q9NP78 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB9Q9NP78 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB9Q9NP78 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB9Q9NP78 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB9Q9NP78 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ABCB9Q9NP78 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB9Q9NP78 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB9Q9NP78 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB9Q9NP78 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB9Q9NP78 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB9Q9NP78 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB9Q9NP78 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB9Q9NP78 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB9Q9NP78 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB9Q9NP78 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB9Q9NP78 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB9Q9NP78 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB9Q9NP78 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB9Q9NP78 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB9Q9NP78 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB9Q9NP78 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB9Q9NP78 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB9Q9NP78 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB9Q9NP78 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB9Q9NP78 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB9Q9NP78 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms