Protein–RNA interactions for Protein: Q9H930

SP140L, Nuclear body protein SP140-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140LQ9H930 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SP140LQ9H930 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP140LQ9H930 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP140LQ9H930 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SP140LQ9H930 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP140LQ9H930 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SP140LQ9H930 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SP140LQ9H930 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SP140LQ9H930 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SP140LQ9H930 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SP140LQ9H930 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SP140LQ9H930 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP140LQ9H930 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP140LQ9H930 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SP140LQ9H930 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SP140LQ9H930 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP140LQ9H930 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP140LQ9H930 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP140LQ9H930 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP140LQ9H930 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP140LQ9H930 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SP140LQ9H930 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP140LQ9H930 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SP140LQ9H930 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SP140LQ9H930 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SP140LQ9H930 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SP140LQ9H930 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SP140LQ9H930 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SP140LQ9H930 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SP140LQ9H930 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SP140LQ9H930 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SP140LQ9H930 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SP140LQ9H930 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SP140LQ9H930 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SP140LQ9H930 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SP140LQ9H930 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SP140LQ9H930 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SP140LQ9H930 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SP140LQ9H930 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP140LQ9H930 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP140LQ9H930 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SP140LQ9H930 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SP140LQ9H930 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP140LQ9H930 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP140LQ9H930 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP140LQ9H930 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP140LQ9H930 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SP140LQ9H930 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP140LQ9H930 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP140LQ9H930 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SP140LQ9H930 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SP140LQ9H930 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SP140LQ9H930 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SP140LQ9H930 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SP140LQ9H930 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SP140LQ9H930 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SP140LQ9H930 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP140LQ9H930 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP140LQ9H930 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP140LQ9H930 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SP140LQ9H930 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SP140LQ9H930 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SP140LQ9H930 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SP140LQ9H930 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SP140LQ9H930 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SP140LQ9H930 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SP140LQ9H930 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SP140LQ9H930 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP140LQ9H930 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP140LQ9H930 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP140LQ9H930 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP140LQ9H930 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP140LQ9H930 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP140LQ9H930 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP140LQ9H930 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP140LQ9H930 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP140LQ9H930 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP140LQ9H930 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP140LQ9H930 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SP140LQ9H930 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP140LQ9H930 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SP140LQ9H930 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP140LQ9H930 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP140LQ9H930 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP140LQ9H930 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SP140LQ9H930 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SP140LQ9H930 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SP140LQ9H930 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SP140LQ9H930 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP140LQ9H930 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP140LQ9H930 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP140LQ9H930 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP140LQ9H930 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP140LQ9H930 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SP140LQ9H930 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SP140LQ9H930 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SP140LQ9H930 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP140LQ9H930 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP140LQ9H930 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SP140LQ9H930 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms