Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
SCAF1Q9H7N4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
SCAF1Q9H7N4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
SCAF1Q9H7N4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
SCAF1Q9H7N4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
SCAF1Q9H7N4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
SCAF1Q9H7N4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC42.67■■■■■ 4.42
SCAF1Q9H7N4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
SCAF1Q9H7N4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC42.63■■■■■ 4.41
SCAF1Q9H7N4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
SCAF1Q9H7N4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
SCAF1Q9H7N4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
SCAF1Q9H7N4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
SCAF1Q9H7N4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
SCAF1Q9H7N4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
SCAF1Q9H7N4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
SCAF1Q9H7N4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
SCAF1Q9H7N4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
SCAF1Q9H7N4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
SCAF1Q9H7N4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
SCAF1Q9H7N4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
SCAF1Q9H7N4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
SCAF1Q9H7N4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
SCAF1Q9H7N4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
SCAF1Q9H7N4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
SCAF1Q9H7N4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
SCAF1Q9H7N4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
SCAF1Q9H7N4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.37
SCAF1Q9H7N4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
SCAF1Q9H7N4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
SCAF1Q9H7N4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
SCAF1Q9H7N4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
SCAF1Q9H7N4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
SCAF1Q9H7N4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
SCAF1Q9H7N4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
SCAF1Q9H7N4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
SCAF1Q9H7N4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
SCAF1Q9H7N4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
SCAF1Q9H7N4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
SCAF1Q9H7N4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
SCAF1Q9H7N4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
SCAF1Q9H7N4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
SCAF1Q9H7N4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
SCAF1Q9H7N4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC42.09■■■■■ 4.33
SCAF1Q9H7N4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
SCAF1Q9H7N4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
SCAF1Q9H7N4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
SCAF1Q9H7N4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
SCAF1Q9H7N4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
SCAF1Q9H7N4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
SCAF1Q9H7N4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC42.01■■■■■ 4.32
SCAF1Q9H7N4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
SCAF1Q9H7N4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
SCAF1Q9H7N4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
SCAF1Q9H7N4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
SCAF1Q9H7N4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
SCAF1Q9H7N4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
SCAF1Q9H7N4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
SCAF1Q9H7N4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SCAF1Q9H7N4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC41.83■■■■■ 4.29
SCAF1Q9H7N4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
SCAF1Q9H7N4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
SCAF1Q9H7N4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC41.82■■■■■ 4.29
SCAF1Q9H7N4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
SCAF1Q9H7N4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
SCAF1Q9H7N4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
SCAF1Q9H7N4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
SCAF1Q9H7N4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.74■■■■■ 4.27
SCAF1Q9H7N4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
SCAF1Q9H7N4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
SCAF1Q9H7N4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
SCAF1Q9H7N4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
SCAF1Q9H7N4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
SCAF1Q9H7N4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
SCAF1Q9H7N4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
SCAF1Q9H7N4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
SCAF1Q9H7N4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
SCAF1Q9H7N4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
SCAF1Q9H7N4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
SCAF1Q9H7N4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
SCAF1Q9H7N4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
SCAF1Q9H7N4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
SCAF1Q9H7N4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
SCAF1Q9H7N4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SCAF1Q9H7N4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.23
SCAF1Q9H7N4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
SCAF1Q9H7N4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
SCAF1Q9H7N4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
SCAF1Q9H7N4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SCAF1Q9H7N4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SCAF1Q9H7N4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
SCAF1Q9H7N4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
SCAF1Q9H7N4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
SCAF1Q9H7N4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
SCAF1Q9H7N4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
SCAF1Q9H7N4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
SCAF1Q9H7N4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
SCAF1Q9H7N4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
SCAF1Q9H7N4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
SCAF1Q9H7N4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms