Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX17Q9H6I2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX17Q9H6I2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX17Q9H6I2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX17Q9H6I2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX17Q9H6I2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX17Q9H6I2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX17Q9H6I2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SOX17Q9H6I2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SOX17Q9H6I2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SOX17Q9H6I2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SOX17Q9H6I2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SOX17Q9H6I2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SOX17Q9H6I2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SOX17Q9H6I2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SOX17Q9H6I2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SOX17Q9H6I2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SOX17Q9H6I2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SOX17Q9H6I2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SOX17Q9H6I2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOX17Q9H6I2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOX17Q9H6I2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOX17Q9H6I2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SOX17Q9H6I2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SOX17Q9H6I2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SOX17Q9H6I2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SOX17Q9H6I2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SOX17Q9H6I2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOX17Q9H6I2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SOX17Q9H6I2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOX17Q9H6I2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SOX17Q9H6I2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOX17Q9H6I2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOX17Q9H6I2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOX17Q9H6I2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOX17Q9H6I2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOX17Q9H6I2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOX17Q9H6I2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOX17Q9H6I2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOX17Q9H6I2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOX17Q9H6I2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOX17Q9H6I2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOX17Q9H6I2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOX17Q9H6I2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOX17Q9H6I2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOX17Q9H6I2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOX17Q9H6I2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOX17Q9H6I2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOX17Q9H6I2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOX17Q9H6I2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOX17Q9H6I2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOX17Q9H6I2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SOX17Q9H6I2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SOX17Q9H6I2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SOX17Q9H6I2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SOX17Q9H6I2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SOX17Q9H6I2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SOX17Q9H6I2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOX17Q9H6I2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SOX17Q9H6I2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOX17Q9H6I2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SOX17Q9H6I2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX17Q9H6I2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SOX17Q9H6I2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOX17Q9H6I2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOX17Q9H6I2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SOX17Q9H6I2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SOX17Q9H6I2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SOX17Q9H6I2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOX17Q9H6I2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOX17Q9H6I2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SOX17Q9H6I2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SOX17Q9H6I2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOX17Q9H6I2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX17Q9H6I2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SOX17Q9H6I2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SOX17Q9H6I2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SOX17Q9H6I2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX17Q9H6I2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX17Q9H6I2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SOX17Q9H6I2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX17Q9H6I2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX17Q9H6I2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX17Q9H6I2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SOX17Q9H6I2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOX17Q9H6I2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOX17Q9H6I2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOX17Q9H6I2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOX17Q9H6I2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOX17Q9H6I2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOX17Q9H6I2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOX17Q9H6I2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOX17Q9H6I2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOX17Q9H6I2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX17Q9H6I2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX17Q9H6I2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SOX17Q9H6I2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOX17Q9H6I2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOX17Q9H6I2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOX17Q9H6I2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms