Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SDCBP2Q9H190 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SDCBP2Q9H190 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SDCBP2Q9H190 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SDCBP2Q9H190 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SDCBP2Q9H190 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SDCBP2Q9H190 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SDCBP2Q9H190 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SDCBP2Q9H190 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SDCBP2Q9H190 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SDCBP2Q9H190 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SDCBP2Q9H190 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SDCBP2Q9H190 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SDCBP2Q9H190 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SDCBP2Q9H190 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SDCBP2Q9H190 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SDCBP2Q9H190 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SDCBP2Q9H190 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SDCBP2Q9H190 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SDCBP2Q9H190 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SDCBP2Q9H190 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SDCBP2Q9H190 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SDCBP2Q9H190 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SDCBP2Q9H190 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SDCBP2Q9H190 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SDCBP2Q9H190 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SDCBP2Q9H190 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SDCBP2Q9H190 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SDCBP2Q9H190 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SDCBP2Q9H190 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SDCBP2Q9H190 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SDCBP2Q9H190 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SDCBP2Q9H190 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SDCBP2Q9H190 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SDCBP2Q9H190 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SDCBP2Q9H190 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SDCBP2Q9H190 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SDCBP2Q9H190 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SDCBP2Q9H190 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SDCBP2Q9H190 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SDCBP2Q9H190 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SDCBP2Q9H190 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SDCBP2Q9H190 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SDCBP2Q9H190 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SDCBP2Q9H190 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SDCBP2Q9H190 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SDCBP2Q9H190 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SDCBP2Q9H190 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SDCBP2Q9H190 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SDCBP2Q9H190 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SDCBP2Q9H190 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SDCBP2Q9H190 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SDCBP2Q9H190 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SDCBP2Q9H190 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SDCBP2Q9H190 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SDCBP2Q9H190 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SDCBP2Q9H190 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SDCBP2Q9H190 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SDCBP2Q9H190 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SDCBP2Q9H190 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SDCBP2Q9H190 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SDCBP2Q9H190 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SDCBP2Q9H190 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SDCBP2Q9H190 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SDCBP2Q9H190 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SDCBP2Q9H190 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SDCBP2Q9H190 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SDCBP2Q9H190 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SDCBP2Q9H190 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SDCBP2Q9H190 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SDCBP2Q9H190 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SDCBP2Q9H190 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SDCBP2Q9H190 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SDCBP2Q9H190 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SDCBP2Q9H190 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SDCBP2Q9H190 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SDCBP2Q9H190 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SDCBP2Q9H190 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SDCBP2Q9H190 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SDCBP2Q9H190 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SDCBP2Q9H190 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SDCBP2Q9H190 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SDCBP2Q9H190 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SDCBP2Q9H190 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SDCBP2Q9H190 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SDCBP2Q9H190 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SDCBP2Q9H190 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SDCBP2Q9H190 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SDCBP2Q9H190 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SDCBP2Q9H190 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SDCBP2Q9H190 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SDCBP2Q9H190 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SDCBP2Q9H190 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SDCBP2Q9H190 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SDCBP2Q9H190 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SDCBP2Q9H190 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SDCBP2Q9H190 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SDCBP2Q9H190 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SDCBP2Q9H190 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SDCBP2Q9H190 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms