Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SDCBP2Q9H190 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SDCBP2Q9H190 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
SDCBP2Q9H190 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SDCBP2Q9H190 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SDCBP2Q9H190 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SDCBP2Q9H190 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SDCBP2Q9H190 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SDCBP2Q9H190 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SDCBP2Q9H190 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SDCBP2Q9H190 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SDCBP2Q9H190 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SDCBP2Q9H190 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SDCBP2Q9H190 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SDCBP2Q9H190 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SDCBP2Q9H190 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SDCBP2Q9H190 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SDCBP2Q9H190 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SDCBP2Q9H190 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SDCBP2Q9H190 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SDCBP2Q9H190 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SDCBP2Q9H190 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SDCBP2Q9H190 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SDCBP2Q9H190 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SDCBP2Q9H190 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SDCBP2Q9H190 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
SDCBP2Q9H190 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SDCBP2Q9H190 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SDCBP2Q9H190 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SDCBP2Q9H190 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SDCBP2Q9H190 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SDCBP2Q9H190 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SDCBP2Q9H190 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SDCBP2Q9H190 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SDCBP2Q9H190 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SDCBP2Q9H190 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SDCBP2Q9H190 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SDCBP2Q9H190 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SDCBP2Q9H190 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SDCBP2Q9H190 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SDCBP2Q9H190 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SDCBP2Q9H190 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SDCBP2Q9H190 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SDCBP2Q9H190 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SDCBP2Q9H190 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SDCBP2Q9H190 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SDCBP2Q9H190 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SDCBP2Q9H190 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SDCBP2Q9H190 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SDCBP2Q9H190 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SDCBP2Q9H190 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SDCBP2Q9H190 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SDCBP2Q9H190 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SDCBP2Q9H190 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SDCBP2Q9H190 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SDCBP2Q9H190 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SDCBP2Q9H190 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SDCBP2Q9H190 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SDCBP2Q9H190 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SDCBP2Q9H190 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SDCBP2Q9H190 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SDCBP2Q9H190 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SDCBP2Q9H190 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SDCBP2Q9H190 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SDCBP2Q9H190 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SDCBP2Q9H190 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SDCBP2Q9H190 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
SDCBP2Q9H190 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
SDCBP2Q9H190 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SDCBP2Q9H190 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SDCBP2Q9H190 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SDCBP2Q9H190 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SDCBP2Q9H190 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SDCBP2Q9H190 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SDCBP2Q9H190 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SDCBP2Q9H190 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SDCBP2Q9H190 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SDCBP2Q9H190 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SDCBP2Q9H190 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SDCBP2Q9H190 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SDCBP2Q9H190 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
SDCBP2Q9H190 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SDCBP2Q9H190 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SDCBP2Q9H190 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SDCBP2Q9H190 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SDCBP2Q9H190 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SDCBP2Q9H190 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SDCBP2Q9H190 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SDCBP2Q9H190 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SDCBP2Q9H190 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SDCBP2Q9H190 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SDCBP2Q9H190 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SDCBP2Q9H190 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SDCBP2Q9H190 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SDCBP2Q9H190 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SDCBP2Q9H190 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SDCBP2Q9H190 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SDCBP2Q9H190 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SDCBP2Q9H190 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SDCBP2Q9H190 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms