Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC22A4Q9H015 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC22A4Q9H015 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC22A4Q9H015 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC22A4Q9H015 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC22A4Q9H015 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC22A4Q9H015 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC22A4Q9H015 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC22A4Q9H015 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC22A4Q9H015 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC22A4Q9H015 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC22A4Q9H015 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC22A4Q9H015 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC22A4Q9H015 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC22A4Q9H015 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC22A4Q9H015 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC22A4Q9H015 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC22A4Q9H015 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC22A4Q9H015 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC22A4Q9H015 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC22A4Q9H015 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC22A4Q9H015 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC22A4Q9H015 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC22A4Q9H015 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC22A4Q9H015 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC22A4Q9H015 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC22A4Q9H015 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC22A4Q9H015 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC22A4Q9H015 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC22A4Q9H015 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC22A4Q9H015 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC22A4Q9H015 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC22A4Q9H015 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC22A4Q9H015 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC22A4Q9H015 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC22A4Q9H015 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC22A4Q9H015 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC22A4Q9H015 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC22A4Q9H015 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC22A4Q9H015 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC22A4Q9H015 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC22A4Q9H015 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC22A4Q9H015 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC22A4Q9H015 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC22A4Q9H015 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC22A4Q9H015 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC22A4Q9H015 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC22A4Q9H015 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC22A4Q9H015 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC22A4Q9H015 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC22A4Q9H015 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC22A4Q9H015 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC22A4Q9H015 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC22A4Q9H015 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC22A4Q9H015 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC22A4Q9H015 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC22A4Q9H015 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC22A4Q9H015 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC22A4Q9H015 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC22A4Q9H015 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC22A4Q9H015 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC22A4Q9H015 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC22A4Q9H015 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC22A4Q9H015 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC22A4Q9H015 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC22A4Q9H015 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC22A4Q9H015 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC22A4Q9H015 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC22A4Q9H015 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC22A4Q9H015 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC22A4Q9H015 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC22A4Q9H015 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC22A4Q9H015 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC22A4Q9H015 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC22A4Q9H015 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC22A4Q9H015 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC22A4Q9H015 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC22A4Q9H015 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC22A4Q9H015 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC22A4Q9H015 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC22A4Q9H015 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC22A4Q9H015 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC22A4Q9H015 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC22A4Q9H015 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC22A4Q9H015 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC22A4Q9H015 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC22A4Q9H015 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC22A4Q9H015 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC22A4Q9H015 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC22A4Q9H015 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC22A4Q9H015 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC22A4Q9H015 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC22A4Q9H015 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC22A4Q9H015 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC22A4Q9H015 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC22A4Q9H015 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC22A4Q9H015 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC22A4Q9H015 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC22A4Q9H015 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC22A4Q9H015 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms