Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMUB1Q9BVT8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMUB1Q9BVT8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMUB1Q9BVT8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMUB1Q9BVT8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMUB1Q9BVT8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMUB1Q9BVT8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMUB1Q9BVT8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMUB1Q9BVT8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMUB1Q9BVT8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMUB1Q9BVT8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMUB1Q9BVT8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMUB1Q9BVT8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMUB1Q9BVT8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMUB1Q9BVT8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMUB1Q9BVT8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMUB1Q9BVT8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMUB1Q9BVT8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMUB1Q9BVT8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMUB1Q9BVT8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMUB1Q9BVT8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMUB1Q9BVT8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMUB1Q9BVT8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMUB1Q9BVT8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMUB1Q9BVT8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMUB1Q9BVT8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMUB1Q9BVT8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMUB1Q9BVT8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMUB1Q9BVT8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMUB1Q9BVT8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMUB1Q9BVT8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMUB1Q9BVT8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMUB1Q9BVT8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMUB1Q9BVT8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMUB1Q9BVT8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMUB1Q9BVT8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMUB1Q9BVT8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMUB1Q9BVT8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMUB1Q9BVT8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMUB1Q9BVT8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMUB1Q9BVT8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMUB1Q9BVT8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMUB1Q9BVT8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMUB1Q9BVT8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMUB1Q9BVT8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMUB1Q9BVT8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMUB1Q9BVT8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMUB1Q9BVT8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMUB1Q9BVT8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMUB1Q9BVT8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMUB1Q9BVT8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMUB1Q9BVT8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMUB1Q9BVT8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMUB1Q9BVT8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMUB1Q9BVT8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMUB1Q9BVT8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMUB1Q9BVT8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMUB1Q9BVT8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMUB1Q9BVT8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMUB1Q9BVT8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMUB1Q9BVT8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMUB1Q9BVT8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMUB1Q9BVT8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMUB1Q9BVT8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMUB1Q9BVT8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMUB1Q9BVT8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMUB1Q9BVT8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMUB1Q9BVT8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMUB1Q9BVT8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMUB1Q9BVT8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMUB1Q9BVT8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMUB1Q9BVT8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMUB1Q9BVT8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMUB1Q9BVT8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMUB1Q9BVT8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMUB1Q9BVT8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMUB1Q9BVT8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMUB1Q9BVT8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMUB1Q9BVT8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMUB1Q9BVT8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMUB1Q9BVT8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMUB1Q9BVT8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMUB1Q9BVT8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMUB1Q9BVT8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMUB1Q9BVT8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMUB1Q9BVT8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMUB1Q9BVT8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMUB1Q9BVT8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMUB1Q9BVT8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMUB1Q9BVT8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMUB1Q9BVT8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMUB1Q9BVT8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMUB1Q9BVT8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMUB1Q9BVT8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMUB1Q9BVT8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMUB1Q9BVT8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMUB1Q9BVT8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMUB1Q9BVT8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMUB1Q9BVT8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMUB1Q9BVT8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms