Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GAL3ST1Q99999 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GAL3ST1Q99999 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GAL3ST1Q99999 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GAL3ST1Q99999 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GAL3ST1Q99999 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GAL3ST1Q99999 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GAL3ST1Q99999 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GAL3ST1Q99999 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GAL3ST1Q99999 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GAL3ST1Q99999 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GAL3ST1Q99999 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GAL3ST1Q99999 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GAL3ST1Q99999 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GAL3ST1Q99999 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GAL3ST1Q99999 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GAL3ST1Q99999 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAL3ST1Q99999 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAL3ST1Q99999 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GAL3ST1Q99999 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GAL3ST1Q99999 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GAL3ST1Q99999 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GAL3ST1Q99999 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GAL3ST1Q99999 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GAL3ST1Q99999 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GAL3ST1Q99999 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GAL3ST1Q99999 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GAL3ST1Q99999 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GAL3ST1Q99999 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GAL3ST1Q99999 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GAL3ST1Q99999 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GAL3ST1Q99999 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GAL3ST1Q99999 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GAL3ST1Q99999 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GAL3ST1Q99999 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GAL3ST1Q99999 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GAL3ST1Q99999 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GAL3ST1Q99999 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GAL3ST1Q99999 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GAL3ST1Q99999 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GAL3ST1Q99999 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GAL3ST1Q99999 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GAL3ST1Q99999 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GAL3ST1Q99999 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GAL3ST1Q99999 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GAL3ST1Q99999 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GAL3ST1Q99999 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GAL3ST1Q99999 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GAL3ST1Q99999 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GAL3ST1Q99999 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GAL3ST1Q99999 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GAL3ST1Q99999 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GAL3ST1Q99999 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GAL3ST1Q99999 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GAL3ST1Q99999 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAL3ST1Q99999 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GAL3ST1Q99999 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GAL3ST1Q99999 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAL3ST1Q99999 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GAL3ST1Q99999 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GAL3ST1Q99999 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAL3ST1Q99999 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAL3ST1Q99999 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GAL3ST1Q99999 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAL3ST1Q99999 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAL3ST1Q99999 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAL3ST1Q99999 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAL3ST1Q99999 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAL3ST1Q99999 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAL3ST1Q99999 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAL3ST1Q99999 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAL3ST1Q99999 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAL3ST1Q99999 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAL3ST1Q99999 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAL3ST1Q99999 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAL3ST1Q99999 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAL3ST1Q99999 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GAL3ST1Q99999 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GAL3ST1Q99999 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GAL3ST1Q99999 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GAL3ST1Q99999 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAL3ST1Q99999 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAL3ST1Q99999 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAL3ST1Q99999 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAL3ST1Q99999 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAL3ST1Q99999 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAL3ST1Q99999 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAL3ST1Q99999 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAL3ST1Q99999 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAL3ST1Q99999 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAL3ST1Q99999 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAL3ST1Q99999 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GAL3ST1Q99999 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAL3ST1Q99999 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAL3ST1Q99999 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAL3ST1Q99999 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAL3ST1Q99999 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAL3ST1Q99999 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAL3ST1Q99999 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAL3ST1Q99999 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms