Protein–RNA interactions for Protein: Q99700

ATXN2, Ataxin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2Q99700 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ATXN2Q99700 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ATXN2Q99700 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATXN2Q99700 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATXN2Q99700 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATXN2Q99700 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATXN2Q99700 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATXN2Q99700 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATXN2Q99700 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ATXN2Q99700 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATXN2Q99700 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATXN2Q99700 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATXN2Q99700 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATXN2Q99700 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATXN2Q99700 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATXN2Q99700 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATXN2Q99700 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATXN2Q99700 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATXN2Q99700 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATXN2Q99700 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATXN2Q99700 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATXN2Q99700 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATXN2Q99700 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATXN2Q99700 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATXN2Q99700 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATXN2Q99700 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ATXN2Q99700 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATXN2Q99700 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATXN2Q99700 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATXN2Q99700 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATXN2Q99700 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATXN2Q99700 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATXN2Q99700 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATXN2Q99700 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATXN2Q99700 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATXN2Q99700 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATXN2Q99700 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATXN2Q99700 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ATXN2Q99700 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATXN2Q99700 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.33
ATXN2Q99700 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATXN2Q99700 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATXN2Q99700 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATXN2Q99700 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATXN2Q99700 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATXN2Q99700 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATXN2Q99700 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATXN2Q99700 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATXN2Q99700 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATXN2Q99700 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATXN2Q99700 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATXN2Q99700 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATXN2Q99700 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATXN2Q99700 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATXN2Q99700 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATXN2Q99700 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ATXN2Q99700 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATXN2Q99700 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATXN2Q99700 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATXN2Q99700 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATXN2Q99700 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATXN2Q99700 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATXN2Q99700 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATXN2Q99700 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATXN2Q99700 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATXN2Q99700 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATXN2Q99700 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATXN2Q99700 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATXN2Q99700 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATXN2Q99700 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATXN2Q99700 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATXN2Q99700 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATXN2Q99700 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATXN2Q99700 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATXN2Q99700 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATXN2Q99700 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATXN2Q99700 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATXN2Q99700 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATXN2Q99700 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATXN2Q99700 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATXN2Q99700 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATXN2Q99700 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATXN2Q99700 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATXN2Q99700 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATXN2Q99700 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATXN2Q99700 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATXN2Q99700 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATXN2Q99700 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATXN2Q99700 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATXN2Q99700 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATXN2Q99700 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATXN2Q99700 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATXN2Q99700 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATXN2Q99700 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATXN2Q99700 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATXN2Q99700 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATXN2Q99700 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATXN2Q99700 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATXN2Q99700 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATXN2Q99700 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms