Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD4LQ96PU5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD4LQ96PU5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD4LQ96PU5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD4LQ96PU5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD4LQ96PU5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD4LQ96PU5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD4LQ96PU5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD4LQ96PU5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD4LQ96PU5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD4LQ96PU5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEDD4LQ96PU5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD4LQ96PU5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD4LQ96PU5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD4LQ96PU5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD4LQ96PU5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD4LQ96PU5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD4LQ96PU5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD4LQ96PU5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD4LQ96PU5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD4LQ96PU5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD4LQ96PU5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD4LQ96PU5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD4LQ96PU5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD4LQ96PU5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD4LQ96PU5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD4LQ96PU5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD4LQ96PU5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD4LQ96PU5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD4LQ96PU5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD4LQ96PU5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD4LQ96PU5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD4LQ96PU5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD4LQ96PU5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NEDD4LQ96PU5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NEDD4LQ96PU5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NEDD4LQ96PU5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NEDD4LQ96PU5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD4LQ96PU5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEDD4LQ96PU5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEDD4LQ96PU5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD4LQ96PU5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEDD4LQ96PU5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEDD4LQ96PU5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD4LQ96PU5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD4LQ96PU5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD4LQ96PU5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD4LQ96PU5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEDD4LQ96PU5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD4LQ96PU5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEDD4LQ96PU5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD4LQ96PU5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEDD4LQ96PU5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEDD4LQ96PU5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD4LQ96PU5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEDD4LQ96PU5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD4LQ96PU5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD4LQ96PU5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD4LQ96PU5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD4LQ96PU5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD4LQ96PU5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD4LQ96PU5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD4LQ96PU5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD4LQ96PU5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD4LQ96PU5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD4LQ96PU5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD4LQ96PU5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD4LQ96PU5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD4LQ96PU5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD4LQ96PU5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD4LQ96PU5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD4LQ96PU5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD4LQ96PU5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD4LQ96PU5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD4LQ96PU5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD4LQ96PU5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD4LQ96PU5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD4LQ96PU5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEDD4LQ96PU5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD4LQ96PU5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD4LQ96PU5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD4LQ96PU5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD4LQ96PU5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD4LQ96PU5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD4LQ96PU5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD4LQ96PU5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4LQ96PU5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEDD4LQ96PU5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEDD4LQ96PU5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEDD4LQ96PU5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEDD4LQ96PU5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEDD4LQ96PU5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD4LQ96PU5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEDD4LQ96PU5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEDD4LQ96PU5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD4LQ96PU5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEDD4LQ96PU5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEDD4LQ96PU5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEDD4LQ96PU5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEDD4LQ96PU5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms