Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEDD4LQ96PU5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEDD4LQ96PU5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEDD4LQ96PU5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEDD4LQ96PU5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NEDD4LQ96PU5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEDD4LQ96PU5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEDD4LQ96PU5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEDD4LQ96PU5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEDD4LQ96PU5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEDD4LQ96PU5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEDD4LQ96PU5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEDD4LQ96PU5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NEDD4LQ96PU5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD4LQ96PU5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NEDD4LQ96PU5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEDD4LQ96PU5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEDD4LQ96PU5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEDD4LQ96PU5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NEDD4LQ96PU5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEDD4LQ96PU5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEDD4LQ96PU5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEDD4LQ96PU5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD4LQ96PU5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD4LQ96PU5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD4LQ96PU5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD4LQ96PU5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEDD4LQ96PU5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD4LQ96PU5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD4LQ96PU5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD4LQ96PU5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEDD4LQ96PU5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEDD4LQ96PU5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NEDD4LQ96PU5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD4LQ96PU5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEDD4LQ96PU5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD4LQ96PU5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEDD4LQ96PU5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD4LQ96PU5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD4LQ96PU5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD4LQ96PU5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD4LQ96PU5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD4LQ96PU5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD4LQ96PU5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD4LQ96PU5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEDD4LQ96PU5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEDD4LQ96PU5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEDD4LQ96PU5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEDD4LQ96PU5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD4LQ96PU5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD4LQ96PU5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEDD4LQ96PU5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEDD4LQ96PU5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEDD4LQ96PU5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD4LQ96PU5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEDD4LQ96PU5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD4LQ96PU5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEDD4LQ96PU5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD4LQ96PU5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD4LQ96PU5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD4LQ96PU5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD4LQ96PU5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEDD4LQ96PU5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD4LQ96PU5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD4LQ96PU5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD4LQ96PU5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEDD4LQ96PU5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD4LQ96PU5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEDD4LQ96PU5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD4LQ96PU5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD4LQ96PU5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD4LQ96PU5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD4LQ96PU5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD4LQ96PU5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD4LQ96PU5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD4LQ96PU5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD4LQ96PU5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD4LQ96PU5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD4LQ96PU5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD4LQ96PU5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD4LQ96PU5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEDD4LQ96PU5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD4LQ96PU5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD4LQ96PU5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD4LQ96PU5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD4LQ96PU5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD4LQ96PU5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD4LQ96PU5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD4LQ96PU5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD4LQ96PU5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD4LQ96PU5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD4LQ96PU5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD4LQ96PU5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEDD4LQ96PU5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEDD4LQ96PU5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEDD4LQ96PU5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEDD4LQ96PU5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEDD4LQ96PU5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD4LQ96PU5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD4LQ96PU5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms