Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFXN2Q96NB2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFXN2Q96NB2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SFXN2Q96NB2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFXN2Q96NB2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SFXN2Q96NB2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFXN2Q96NB2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFXN2Q96NB2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SFXN2Q96NB2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFXN2Q96NB2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFXN2Q96NB2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SFXN2Q96NB2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFXN2Q96NB2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SFXN2Q96NB2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFXN2Q96NB2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFXN2Q96NB2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFXN2Q96NB2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFXN2Q96NB2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFXN2Q96NB2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFXN2Q96NB2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFXN2Q96NB2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFXN2Q96NB2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFXN2Q96NB2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFXN2Q96NB2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFXN2Q96NB2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFXN2Q96NB2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SFXN2Q96NB2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SFXN2Q96NB2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFXN2Q96NB2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFXN2Q96NB2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFXN2Q96NB2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SFXN2Q96NB2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SFXN2Q96NB2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SFXN2Q96NB2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SFXN2Q96NB2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFXN2Q96NB2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SFXN2Q96NB2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SFXN2Q96NB2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SFXN2Q96NB2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SFXN2Q96NB2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SFXN2Q96NB2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SFXN2Q96NB2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SFXN2Q96NB2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SFXN2Q96NB2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFXN2Q96NB2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SFXN2Q96NB2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFXN2Q96NB2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SFXN2Q96NB2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SFXN2Q96NB2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SFXN2Q96NB2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFXN2Q96NB2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFXN2Q96NB2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFXN2Q96NB2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFXN2Q96NB2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFXN2Q96NB2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFXN2Q96NB2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFXN2Q96NB2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFXN2Q96NB2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFXN2Q96NB2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFXN2Q96NB2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFXN2Q96NB2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFXN2Q96NB2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFXN2Q96NB2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFXN2Q96NB2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFXN2Q96NB2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFXN2Q96NB2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFXN2Q96NB2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SFXN2Q96NB2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SFXN2Q96NB2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SFXN2Q96NB2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFXN2Q96NB2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFXN2Q96NB2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SFXN2Q96NB2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SFXN2Q96NB2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFXN2Q96NB2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFXN2Q96NB2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SFXN2Q96NB2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SFXN2Q96NB2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFXN2Q96NB2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFXN2Q96NB2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SFXN2Q96NB2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SFXN2Q96NB2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFXN2Q96NB2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFXN2Q96NB2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SFXN2Q96NB2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFXN2Q96NB2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFXN2Q96NB2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFXN2Q96NB2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SFXN2Q96NB2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFXN2Q96NB2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFXN2Q96NB2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFXN2Q96NB2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFXN2Q96NB2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFXN2Q96NB2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFXN2Q96NB2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFXN2Q96NB2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFXN2Q96NB2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFXN2Q96NB2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFXN2Q96NB2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFXN2Q96NB2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms