Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RPGRIP1Q96KN7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RPGRIP1Q96KN7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RPGRIP1Q96KN7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RPGRIP1Q96KN7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
RPGRIP1Q96KN7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RPGRIP1Q96KN7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RPGRIP1Q96KN7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RPGRIP1Q96KN7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RPGRIP1Q96KN7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RPGRIP1Q96KN7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RPGRIP1Q96KN7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
RPGRIP1Q96KN7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RPGRIP1Q96KN7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RPGRIP1Q96KN7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
RPGRIP1Q96KN7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RPGRIP1Q96KN7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RPGRIP1Q96KN7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
RPGRIP1Q96KN7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
RPGRIP1Q96KN7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RPGRIP1Q96KN7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RPGRIP1Q96KN7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RPGRIP1Q96KN7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RPGRIP1Q96KN7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
RPGRIP1Q96KN7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RPGRIP1Q96KN7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RPGRIP1Q96KN7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RPGRIP1Q96KN7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
RPGRIP1Q96KN7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RPGRIP1Q96KN7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RPGRIP1Q96KN7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RPGRIP1Q96KN7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RPGRIP1Q96KN7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RPGRIP1Q96KN7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RPGRIP1Q96KN7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RPGRIP1Q96KN7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RPGRIP1Q96KN7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
RPGRIP1Q96KN7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RPGRIP1Q96KN7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RPGRIP1Q96KN7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RPGRIP1Q96KN7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RPGRIP1Q96KN7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RPGRIP1Q96KN7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RPGRIP1Q96KN7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RPGRIP1Q96KN7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RPGRIP1Q96KN7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RPGRIP1Q96KN7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RPGRIP1Q96KN7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RPGRIP1Q96KN7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RPGRIP1Q96KN7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RPGRIP1Q96KN7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RPGRIP1Q96KN7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RPGRIP1Q96KN7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RPGRIP1Q96KN7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RPGRIP1Q96KN7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RPGRIP1Q96KN7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RPGRIP1Q96KN7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RPGRIP1Q96KN7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RPGRIP1Q96KN7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RPGRIP1Q96KN7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RPGRIP1Q96KN7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RPGRIP1Q96KN7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
RPGRIP1Q96KN7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RPGRIP1Q96KN7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RPGRIP1Q96KN7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RPGRIP1Q96KN7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RPGRIP1Q96KN7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RPGRIP1Q96KN7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RPGRIP1Q96KN7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RPGRIP1Q96KN7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RPGRIP1Q96KN7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RPGRIP1Q96KN7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RPGRIP1Q96KN7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RPGRIP1Q96KN7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RPGRIP1Q96KN7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RPGRIP1Q96KN7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RPGRIP1Q96KN7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RPGRIP1Q96KN7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RPGRIP1Q96KN7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RPGRIP1Q96KN7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RPGRIP1Q96KN7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RPGRIP1Q96KN7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RPGRIP1Q96KN7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RPGRIP1Q96KN7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
RPGRIP1Q96KN7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RPGRIP1Q96KN7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RPGRIP1Q96KN7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RPGRIP1Q96KN7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RPGRIP1Q96KN7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RPGRIP1Q96KN7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RPGRIP1Q96KN7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RPGRIP1Q96KN7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RPGRIP1Q96KN7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
RPGRIP1Q96KN7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RPGRIP1Q96KN7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RPGRIP1Q96KN7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RPGRIP1Q96KN7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RPGRIP1Q96KN7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RPGRIP1Q96KN7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms