Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC45A3Q96JT2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC45A3Q96JT2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC45A3Q96JT2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC45A3Q96JT2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC45A3Q96JT2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC45A3Q96JT2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC45A3Q96JT2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC45A3Q96JT2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC45A3Q96JT2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC45A3Q96JT2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC45A3Q96JT2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC45A3Q96JT2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC45A3Q96JT2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC45A3Q96JT2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC45A3Q96JT2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC45A3Q96JT2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC45A3Q96JT2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC45A3Q96JT2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC45A3Q96JT2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC45A3Q96JT2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC45A3Q96JT2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC45A3Q96JT2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC45A3Q96JT2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC45A3Q96JT2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC45A3Q96JT2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC45A3Q96JT2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC45A3Q96JT2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC45A3Q96JT2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC45A3Q96JT2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC45A3Q96JT2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC45A3Q96JT2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC45A3Q96JT2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC45A3Q96JT2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC45A3Q96JT2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC45A3Q96JT2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC45A3Q96JT2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC45A3Q96JT2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC45A3Q96JT2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC45A3Q96JT2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC45A3Q96JT2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC45A3Q96JT2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC45A3Q96JT2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC45A3Q96JT2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC45A3Q96JT2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC45A3Q96JT2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC45A3Q96JT2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC45A3Q96JT2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC45A3Q96JT2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC45A3Q96JT2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC45A3Q96JT2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC45A3Q96JT2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC45A3Q96JT2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC45A3Q96JT2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC45A3Q96JT2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC45A3Q96JT2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC45A3Q96JT2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC45A3Q96JT2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC45A3Q96JT2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC45A3Q96JT2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC45A3Q96JT2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC45A3Q96JT2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC45A3Q96JT2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC45A3Q96JT2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC45A3Q96JT2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC45A3Q96JT2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC45A3Q96JT2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC45A3Q96JT2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC45A3Q96JT2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC45A3Q96JT2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC45A3Q96JT2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC45A3Q96JT2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC45A3Q96JT2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC45A3Q96JT2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC45A3Q96JT2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC45A3Q96JT2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC45A3Q96JT2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC45A3Q96JT2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC45A3Q96JT2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC45A3Q96JT2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC45A3Q96JT2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC45A3Q96JT2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC45A3Q96JT2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC45A3Q96JT2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC45A3Q96JT2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC45A3Q96JT2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC45A3Q96JT2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC45A3Q96JT2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC45A3Q96JT2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC45A3Q96JT2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC45A3Q96JT2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC45A3Q96JT2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC45A3Q96JT2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC45A3Q96JT2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC45A3Q96JT2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC45A3Q96JT2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC45A3Q96JT2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC45A3Q96JT2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC45A3Q96JT2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC45A3Q96JT2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms