Protein–RNA interactions for Protein: Q96FX8

PERP, p53 apoptosis effector related to PMP-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERPQ96FX8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PERPQ96FX8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PERPQ96FX8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PERPQ96FX8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PERPQ96FX8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PERPQ96FX8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PERPQ96FX8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PERPQ96FX8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PERPQ96FX8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PERPQ96FX8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PERPQ96FX8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PERPQ96FX8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PERPQ96FX8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PERPQ96FX8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PERPQ96FX8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PERPQ96FX8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PERPQ96FX8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PERPQ96FX8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PERPQ96FX8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PERPQ96FX8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PERPQ96FX8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PERPQ96FX8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PERPQ96FX8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PERPQ96FX8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PERPQ96FX8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PERPQ96FX8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PERPQ96FX8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PERPQ96FX8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PERPQ96FX8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PERPQ96FX8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PERPQ96FX8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PERPQ96FX8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PERPQ96FX8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PERPQ96FX8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PERPQ96FX8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PERPQ96FX8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PERPQ96FX8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PERPQ96FX8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PERPQ96FX8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PERPQ96FX8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PERPQ96FX8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PERPQ96FX8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PERPQ96FX8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PERPQ96FX8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PERPQ96FX8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PERPQ96FX8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PERPQ96FX8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PERPQ96FX8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PERPQ96FX8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PERPQ96FX8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PERPQ96FX8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PERPQ96FX8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PERPQ96FX8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PERPQ96FX8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PERPQ96FX8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PERPQ96FX8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PERPQ96FX8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PERPQ96FX8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PERPQ96FX8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PERPQ96FX8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PERPQ96FX8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PERPQ96FX8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PERPQ96FX8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PERPQ96FX8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PERPQ96FX8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PERPQ96FX8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PERPQ96FX8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PERPQ96FX8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PERPQ96FX8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PERPQ96FX8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PERPQ96FX8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PERPQ96FX8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PERPQ96FX8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PERPQ96FX8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PERPQ96FX8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PERPQ96FX8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PERPQ96FX8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PERPQ96FX8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PERPQ96FX8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PERPQ96FX8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PERPQ96FX8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PERPQ96FX8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PERPQ96FX8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PERPQ96FX8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PERPQ96FX8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PERPQ96FX8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PERPQ96FX8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PERPQ96FX8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PERPQ96FX8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PERPQ96FX8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PERPQ96FX8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PERPQ96FX8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PERPQ96FX8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PERPQ96FX8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PERPQ96FX8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PERPQ96FX8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PERPQ96FX8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PERPQ96FX8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PERPQ96FX8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PERPQ96FX8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms