Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
SIRT1Q96EB6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
SIRT1Q96EB6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
SIRT1Q96EB6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
SIRT1Q96EB6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
SIRT1Q96EB6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC41.23■■■■■ 4.19
SIRT1Q96EB6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
SIRT1Q96EB6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
SIRT1Q96EB6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SIRT1Q96EB6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
SIRT1Q96EB6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
SIRT1Q96EB6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SIRT1Q96EB6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
SIRT1Q96EB6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
SIRT1Q96EB6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
SIRT1Q96EB6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SIRT1Q96EB6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
SIRT1Q96EB6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
SIRT1Q96EB6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
SIRT1Q96EB6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
SIRT1Q96EB6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
SIRT1Q96EB6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
SIRT1Q96EB6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SIRT1Q96EB6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SIRT1Q96EB6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
SIRT1Q96EB6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
SIRT1Q96EB6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
SIRT1Q96EB6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
SIRT1Q96EB6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
SIRT1Q96EB6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
SIRT1Q96EB6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
SIRT1Q96EB6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
SIRT1Q96EB6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
SIRT1Q96EB6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
SIRT1Q96EB6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
SIRT1Q96EB6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC40.61■■■■■ 4.09
SIRT1Q96EB6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
SIRT1Q96EB6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
SIRT1Q96EB6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
SIRT1Q96EB6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
SIRT1Q96EB6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
SIRT1Q96EB6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
SIRT1Q96EB6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
SIRT1Q96EB6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
SIRT1Q96EB6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
SIRT1Q96EB6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
SIRT1Q96EB6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
SIRT1Q96EB6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SIRT1Q96EB6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SIRT1Q96EB6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
SIRT1Q96EB6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SIRT1Q96EB6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
SIRT1Q96EB6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
SIRT1Q96EB6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
SIRT1Q96EB6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
SIRT1Q96EB6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
SIRT1Q96EB6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SIRT1Q96EB6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
SIRT1Q96EB6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
SIRT1Q96EB6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
SIRT1Q96EB6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
SIRT1Q96EB6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
SIRT1Q96EB6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SIRT1Q96EB6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SIRT1Q96EB6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
SIRT1Q96EB6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
SIRT1Q96EB6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
SIRT1Q96EB6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
SIRT1Q96EB6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
SIRT1Q96EB6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
SIRT1Q96EB6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4.01
SIRT1Q96EB6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
SIRT1Q96EB6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
SIRT1Q96EB6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
SIRT1Q96EB6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
SIRT1Q96EB6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
SIRT1Q96EB6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
SIRT1Q96EB6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
SIRT1Q96EB6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
SIRT1Q96EB6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
SIRT1Q96EB6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
SIRT1Q96EB6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SIRT1Q96EB6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SIRT1Q96EB6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
SIRT1Q96EB6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
SIRT1Q96EB6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
SIRT1Q96EB6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
SIRT1Q96EB6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
SIRT1Q96EB6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
SIRT1Q96EB6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
SIRT1Q96EB6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
SIRT1Q96EB6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
SIRT1Q96EB6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
SIRT1Q96EB6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
SIRT1Q96EB6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
SIRT1Q96EB6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
SIRT1Q96EB6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
SIRT1Q96EB6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
SIRT1Q96EB6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SIRT1Q96EB6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms