Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCG3Q8WXD2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCG3Q8WXD2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCG3Q8WXD2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCG3Q8WXD2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCG3Q8WXD2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCG3Q8WXD2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCG3Q8WXD2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCG3Q8WXD2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCG3Q8WXD2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SCG3Q8WXD2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCG3Q8WXD2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCG3Q8WXD2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCG3Q8WXD2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCG3Q8WXD2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCG3Q8WXD2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCG3Q8WXD2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCG3Q8WXD2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCG3Q8WXD2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCG3Q8WXD2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCG3Q8WXD2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCG3Q8WXD2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCG3Q8WXD2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCG3Q8WXD2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCG3Q8WXD2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCG3Q8WXD2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCG3Q8WXD2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCG3Q8WXD2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCG3Q8WXD2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCG3Q8WXD2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCG3Q8WXD2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCG3Q8WXD2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCG3Q8WXD2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCG3Q8WXD2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCG3Q8WXD2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCG3Q8WXD2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCG3Q8WXD2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCG3Q8WXD2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCG3Q8WXD2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCG3Q8WXD2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCG3Q8WXD2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCG3Q8WXD2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCG3Q8WXD2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCG3Q8WXD2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCG3Q8WXD2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SCG3Q8WXD2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCG3Q8WXD2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCG3Q8WXD2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCG3Q8WXD2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCG3Q8WXD2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCG3Q8WXD2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCG3Q8WXD2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCG3Q8WXD2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCG3Q8WXD2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCG3Q8WXD2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCG3Q8WXD2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCG3Q8WXD2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCG3Q8WXD2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCG3Q8WXD2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCG3Q8WXD2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCG3Q8WXD2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCG3Q8WXD2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCG3Q8WXD2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCG3Q8WXD2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCG3Q8WXD2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCG3Q8WXD2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCG3Q8WXD2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCG3Q8WXD2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCG3Q8WXD2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCG3Q8WXD2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCG3Q8WXD2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCG3Q8WXD2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCG3Q8WXD2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SCG3Q8WXD2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCG3Q8WXD2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCG3Q8WXD2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCG3Q8WXD2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCG3Q8WXD2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCG3Q8WXD2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCG3Q8WXD2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCG3Q8WXD2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCG3Q8WXD2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCG3Q8WXD2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCG3Q8WXD2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCG3Q8WXD2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCG3Q8WXD2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCG3Q8WXD2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCG3Q8WXD2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCG3Q8WXD2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCG3Q8WXD2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCG3Q8WXD2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCG3Q8WXD2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCG3Q8WXD2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCG3Q8WXD2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCG3Q8WXD2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCG3Q8WXD2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCG3Q8WXD2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCG3Q8WXD2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCG3Q8WXD2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCG3Q8WXD2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms